More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3405 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  100 
 
 
330 aa  659    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  99.7 
 
 
334 aa  657    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  77.96 
 
 
343 aa  476  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  73.6 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  67.29 
 
 
375 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  50.5 
 
 
360 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  49.5 
 
 
356 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  47.99 
 
 
334 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  44.33 
 
 
335 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  41.64 
 
 
327 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  41.72 
 
 
328 aa  242  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  42.24 
 
 
336 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  41.88 
 
 
328 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  42.45 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.5 
 
 
337 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  39.63 
 
 
330 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  39.46 
 
 
321 aa  231  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  44.74 
 
 
325 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  42.14 
 
 
323 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  39.21 
 
 
331 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  44.36 
 
 
325 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  41.05 
 
 
334 aa  229  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  41.9 
 
 
322 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  40.13 
 
 
345 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  40.13 
 
 
345 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.88 
 
 
325 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.88 
 
 
327 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  38.91 
 
 
332 aa  225  9e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  41.83 
 
 
340 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.2 
 
 
330 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  41.27 
 
 
341 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  41.59 
 
 
328 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  43.84 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  43.4 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40.99 
 
 
323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  39.39 
 
 
324 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  37.41 
 
 
336 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  40.49 
 
 
358 aa  222  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  39.94 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.12 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  42.47 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  40.19 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  37.89 
 
 
331 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  39.43 
 
 
326 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  37.89 
 
 
331 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.5 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  43.66 
 
 
334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  38.05 
 
 
330 aa  219  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.49 
 
 
331 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.93 
 
 
330 aa  219  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  41.04 
 
 
333 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  37.8 
 
 
334 aa  218  7.999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.22 
 
 
334 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  38.08 
 
 
330 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  38.07 
 
 
330 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.83 
 
 
335 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  39.73 
 
 
323 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.29 
 
 
327 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  39.46 
 
 
328 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  41.88 
 
 
330 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  37.46 
 
 
324 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.58 
 
 
339 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  40.33 
 
 
327 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.54 
 
 
318 aa  215  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.05 
 
 
356 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  40.06 
 
 
322 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.81 
 
 
341 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  38.41 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  40.67 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  37.54 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.4 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  42.75 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  40.61 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.62 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  39.69 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  38.15 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  39.56 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  40.47 
 
 
328 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  38.49 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  41.38 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  41.24 
 
 
349 aa  212  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.46 
 
 
344 aa  212  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  40.54 
 
 
317 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  43.15 
 
 
330 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  38.07 
 
 
343 aa  212  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.99 
 
 
336 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  37.65 
 
 
329 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  36.92 
 
 
330 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.41 
 
 
360 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  40.07 
 
 
334 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.87 
 
 
310 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  40.54 
 
 
317 aa  211  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.01 
 
 
325 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.14 
 
 
333 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.88 
 
 
324 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.6 
 
 
325 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  36.5 
 
 
332 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.12 
 
 
327 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.54 
 
 
333 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.25 
 
 
328 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>