More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1829 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5132  hypothetical protein  52.52 
 
 		 334 aa  301  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  45.61 
 
 		 356 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  45.27 
 
 		 360 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0124  twin-arginine translocation pathway signal  43.77 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  41.03 
 
 		 327 aa  238  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0822  hypothetical protein  42.86 
 
 		 375 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  43.04 
 
 		 318 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  40.13 
 
 		 315 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4060  hypothetical protein  42.37 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.354383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3405  hypothetical protein  42.37 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.79 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  42.33 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4556  hypothetical protein  40.57 
 
 		 337 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.912833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  39.22 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  36.7 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1076  hypothetical protein  39.47 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.46 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  36.97 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.34 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.34 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.51 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  36.62 
 
 		 329 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.07 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.8 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  39.74 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.27 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.8 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  40.54 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.14 
 
 		 358 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.73 
 
 		 326 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.1 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.61 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  36.27 
 
 		 379 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2519  hypothetical protein  36.73 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.27 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.58 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.54 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  36.84 
 
 		 325 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  41.45 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.19 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  41.73 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.74 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  38.3 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  40.37 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.32 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.85 
 
 		 336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  40.73 
 
 		 335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  36.73 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  35.78 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  38.36 
 
 		 326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.72 
 
 		 339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.33 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  35.87 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  36 
 
 		 320 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6277  hypothetical protein  39.24 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  38.82 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  36.81 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  33.44 
 
 		 339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  36.62 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.85 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  37.54 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  37.78 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  37.88 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  37.15 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3797  extra-cytoplasmic solute receptor  37.81 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.67 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  33.43 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.24 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  38.91 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  39.47 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  34.98 
 
 		 326 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  38.7 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  38.95 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.35 
 
 		 318 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  34.54 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  36.92 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.25 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  36.58 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  38.38 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  37.58 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  36.96 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  35.44 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1221  hypothetical protein  35.91 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  36.11 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3881  hypothetical protein  38.31 
 
 		 312 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0974  hypothetical protein  34.97 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.013055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  38.58 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0797  hypothetical protein  39.06 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.420695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  34.95 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  39.69 
 
 		 328 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  37.5 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  37.41 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  36.14 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>