More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1221 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1221  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  622  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0435  hypothetical protein  62.35 
 
 		 326 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5248  extra-cytoplasmic solute receptor  50.84 
 
 		 333 aa  291  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821441  normal  0.224057 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4419  hypothetical protein  50.67 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  43 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  37.8 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  42.77 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  38.44 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.14 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  38.1 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  38.74 
 
 		 330 aa  215  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  39.66 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  40.63 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.78 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  39.6 
 
 		 339 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  39.12 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  37.61 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.33 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.67 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  36.65 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  39.66 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.67 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  39.3 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.8 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  38.69 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  38.69 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  38.59 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.87 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.8 
 
 		 327 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  35.65 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.66 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.02 
 
 		 360 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 328 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.07 
 
 		 349 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  39.81 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  41.95 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.84 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  38.18 
 
 		 327 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5949  hypothetical protein  37.42 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011365  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  35.91 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  39.37 
 
 		 326 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  39.13 
 
 		 698 aa  203  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  38.63 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  38.87 
 
 		 331 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.44 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  39.87 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.6 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.6 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  39.67 
 
 		 323 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  37.78 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1829  hypothetical protein  35.42 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5307  twin-arginine translocation pathway signal  39.73 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  38.93 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.88 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.21 
 
 		 336 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  39.26 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.13 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.93 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  38.1 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  38.59 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  38.99 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  37.14 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  37.61 
 
 		 324 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  37.7 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  36.93 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.9 
 
 		 318 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  37.81 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  38.16 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  38.39 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  36.68 
 
 		 356 aa  198  9e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  39.22 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  37.42 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  40.46 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  38.56 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  37.65 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.73 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  38.34 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1654  hypothetical protein  41.39 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.917353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  37.46 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.67 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  38.34 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  38.31 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.85 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  37.42 
 
 		 336 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  37 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  37.33 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  38.41 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1368  hypothetical protein  39.06 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.391308  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  34.56 
 
 		 325 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  36.96 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.27 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  36.39 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>