More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6079 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  67.28 
 
 		 336 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.58 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  39.29 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.84 
 
 		 336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  40.41 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  41.05 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  39.2 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  40.31 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.97 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  41.13 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  37.5 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  36.62 
 
 		 356 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.06 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.66 
 
 		 330 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.58 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  39.2 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  39.88 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3173  hypothetical protein  41.98 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.21 
 
 		 337 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  39.57 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  39.57 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  37.22 
 
 		 326 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3086  hypothetical protein  41.36 
 
 		 332 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  37.97 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.88 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  40.37 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.27 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.58 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  37.92 
 
 		 335 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  37.01 
 
 		 337 aa  208  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.51 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.95 
 
 		 332 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5474  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  40.99 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.77 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  38.72 
 
 		 341 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.02 
 
 		 344 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.98 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  36.83 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  43.08 
 
 		 329 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.98 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  39.11 
 
 		 340 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  39.51 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  35.18 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  39.26 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.51 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.41 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  36.58 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.39 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.58 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  37.88 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.99 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  36.33 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.41 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0350  hypothetical protein  36.7 
 
 		 336 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  35.09 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.94 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.75 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  35.94 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0576  hypothetical protein  37.69 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.43 
 
 		 331 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  40.75 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  35.35 
 
 		 320 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.05 
 
 		 336 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  202  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 		 328 aa  202  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.91 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  37.16 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  37.42 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  36.03 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.67 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  37.37 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  37.93 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.6 
 
 		 358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  38.91 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  35.33 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  37.88 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  37.29 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  38.38 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.27 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  37.98 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  36.95 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3214  hypothetical protein  36.75 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  37.62 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  37.12 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2466  hypothetical protein  37.37 
 
 		 321 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  37.22 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  37.67 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  37.38 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.79 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  39 
 
 		 342 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.35 
 
 		 334 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  37.96 
 
 		 328 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  35.83 
 
 		 325 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3869  hypothetical protein  37.92 
 
 		 332 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0415956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4699  hypothetical protein  42.96 
 
 		 343 aa  198  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  35.49 
 
 		 335 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>