More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1691 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1691  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  657    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4478  hypothetical protein  66.97 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.23415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2846  hypothetical protein  69.65 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.716229  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3523  hypothetical protein  69.77 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3895  hypothetical protein  65.99 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1693  hypothetical protein  65.08 
 
 		 341 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2127  hypothetical protein  57.89 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2815  hypothetical protein  55.86 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222499  hitchhiker  0.00000272153 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0357  hypothetical protein  57.38 
 
 		 325 aa  345  7e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4438  hypothetical protein  54.88 
 
 		 338 aa  323  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4521  hypothetical protein  45.63 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.843645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  41.96 
 
 		 328 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  42.95 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.59 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.14 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  38.16 
 
 		 335 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.04 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.44 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  37.11 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  40.07 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.05 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  38.05 
 
 		 331 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.49 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  198  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  36.03 
 
 		 335 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.05 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2039  hypothetical protein  39.2 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  36 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  36 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3604  hypothetical protein  37.54 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  37.33 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  37.67 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  38 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  38.44 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  37 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  38.51 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  37.5 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  38.08 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  38.19 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3448  hypothetical protein  36.03 
 
 		 360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  37.58 
 
 		 330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  38.05 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  37.37 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.74 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  38.67 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  39.31 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  40.14 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.56 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.3 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0230  hypothetical protein  35.24 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.297897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  37.46 
 
 		 322 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  37.11 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  36.89 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  36.96 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  36.72 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  34.85 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2562  hypothetical protein  38.07 
 
 		 330 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  37.72 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  39.18 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.33 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1478  hypothetical protein  36 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.66 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.33 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  35.57 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  36.16 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  35.64 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.64 
 
 		 331 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  39.41 
 
 		 349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2823  hypothetical protein  38.54 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628668  normal  0.0754293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  39.43 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.71 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.9 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  37.79 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  35.14 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6257  hypothetical protein  41.05 
 
 		 332 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  34.35 
 
 		 331 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  36.67 
 
 		 329 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.59 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  34.78 
 
 		 336 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.83 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35 
 
 		 334 aa  180  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  37.37 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.45 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5716  hypothetical protein  37.81 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  36.79 
 
 		 474 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.17 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  33.84 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.12 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  38.17 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  33.87 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1233  hypothetical protein  39.1 
 
 		 379 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  36.51 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.29 
 
 		 326 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>