More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5491 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5491  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 321 aa  643    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  39.17 
 
 		 356 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  37.93 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  43.52 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  39.66 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.47 
 
 		 337 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  41.44 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.05 
 
 		 358 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  40.61 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  38.41 
 
 		 326 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  37.1 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  40.33 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.47 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  40.33 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  40.57 
 
 		 341 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.46 
 
 		 330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.23 
 
 		 327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  38.08 
 
 		 341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.37 
 
 		 337 aa  212  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.17 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  35.31 
 
 		 334 aa  212  9e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.62 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.89 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.28 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  38.04 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  39.13 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.31 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.36 
 
 		 336 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.97 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  41.32 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.93 
 
 		 331 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  36.93 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  40.2 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  39.31 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  40.67 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  36.88 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.78 
 
 		 325 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.21 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  37.74 
 
 		 328 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.38 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  36.19 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  37.16 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.94 
 
 		 334 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4553  hypothetical protein  38.68 
 
 		 341 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  36.68 
 
 		 322 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  37.17 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  37.14 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.51 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  36.72 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  35.6 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  37.83 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  38.67 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  38.46 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  38.03 
 
 		 304 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  37.01 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  38.24 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  37.93 
 
 		 339 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  40.77 
 
 		 353 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  39.66 
 
 		 322 aa  202  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  38.85 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.28 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  38.21 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  34.37 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.71 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3530  hypothetical protein  37.92 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  38.36 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.96 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  35.71 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  37.76 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  38.41 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  38.41 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36 
 
 		 337 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  38.73 
 
 		 323 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.45 
 
 		 325 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  37.91 
 
 		 326 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37 
 
 		 345 aa  199  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.76 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  35.51 
 
 		 324 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  40.6 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.58 
 
 		 338 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.37 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0906  hypothetical protein  37.37 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  35.57 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  36.93 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  36.75 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0231  hypothetical protein  33.12 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  37.87 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  37.67 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  37.67 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  37.58 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4503  hypothetical protein  37.7 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  38.44 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  37.17 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>