More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3897 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3897  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  665    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0101322  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3049  hypothetical protein  79.4 
 
 		 330 aa  494  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3512  hypothetical protein  72.82 
 
 		 334 aa  474  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543672  normal  0.304228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  44.33 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  39.94 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  41.98 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  41.98 
 
 		 356 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.28 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  42.39 
 
 		 337 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  41.05 
 
 		 329 aa  245  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  39.76 
 
 		 344 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.38 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.75 
 
 		 328 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  42.02 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.78 
 
 		 325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1351  Fis family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.148208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  43.29 
 
 		 339 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  42.51 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.51 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  39.27 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  40.19 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  42.95 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  41.33 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.12 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  42.28 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.12 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  39.7 
 
 		 328 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.56 
 
 		 335 aa  235  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  40.62 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  39.94 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  41.33 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  42.28 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  40.33 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  38.82 
 
 		 325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  40.27 
 
 		 330 aa  232  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  41.91 
 
 		 310 aa  232  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0267  hypothetical protein  38.72 
 
 		 337 aa  232  7.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.717963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  41.39 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  41.69 
 
 		 330 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  40.9 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  39.44 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  39.8 
 
 		 324 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1757  hypothetical protein  38.74 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  41.77 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3991  hypothetical protein  39.52 
 
 		 319 aa  230  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  41.47 
 
 		 330 aa  230  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.06 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  41.37 
 
 		 334 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  41.81 
 
 		 324 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.25 
 
 		 335 aa  228  9e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.82 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.55 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  37.25 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  40.26 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  39.75 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  41.69 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.53 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  41.39 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  38.92 
 
 		 337 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.98 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  40.46 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  39.01 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  39.4 
 
 		 335 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5452  hypothetical protein  38.7 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6149  extra-cytoplasmic solute receptor protein Bug family  41.67 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.873662 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  41.02 
 
 		 338 aa  223  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  37.71 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  39.8 
 
 		 326 aa  222  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  36.62 
 
 		 333 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  39.53 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0039  hypothetical protein  36.79 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  39.53 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.8 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  42.14 
 
 		 353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.53 
 
 		 328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  39.75 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.36 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  37.54 
 
 		 331 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.74 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6068  hypothetical protein  39.08 
 
 		 324 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  39.57 
 
 		 322 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  38.63 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  38.21 
 
 		 332 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1309  hypothetical protein  39.06 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.2 
 
 		 327 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  40.67 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  40.47 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  37.95 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  39.26 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  38.54 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.39 
 
 		 326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  40.2 
 
 		 361 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.13 
 
 		 323 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  38.07 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  39.14 
 
 		 333 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  36.5 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>