More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2926 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2926  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  66.56 
 
 
327 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1911  hypothetical protein  55.7 
 
 
327 aa  342  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248685  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.13 
 
 
333 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.52 
 
 
335 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.63 
 
 
325 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.91 
 
 
335 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.86 
 
 
328 aa  235  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  41.5 
 
 
331 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  41.16 
 
 
331 aa  229  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  40.82 
 
 
326 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.15 
 
 
332 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.95 
 
 
332 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  40.59 
 
 
330 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  40.59 
 
 
330 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  41.75 
 
 
327 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  38.7 
 
 
324 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  40.14 
 
 
325 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  40.38 
 
 
337 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  37.54 
 
 
324 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.72 
 
 
325 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.72 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  40.13 
 
 
330 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  40.31 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  41.4 
 
 
328 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  36.25 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.41 
 
 
328 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1508  hypothetical protein  40.27 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  41.4 
 
 
328 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  38.26 
 
 
332 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  37.1 
 
 
337 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  39.62 
 
 
333 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  40.13 
 
 
356 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.39 
 
 
322 aa  216  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  37.21 
 
 
330 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4803  hypothetical protein  43 
 
 
474 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  36.02 
 
 
324 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.45 
 
 
328 aa  215  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  42.03 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  37.79 
 
 
323 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.85 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.54 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  39.66 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.31 
 
 
321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  39.8 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  42.48 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  40.97 
 
 
335 aa  212  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  35.78 
 
 
328 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.29 
 
 
327 aa  212  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  36.12 
 
 
322 aa  212  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.62 
 
 
325 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  35.37 
 
 
322 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  37.34 
 
 
331 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  38.94 
 
 
310 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.54 
 
 
332 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  37.34 
 
 
322 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  38.19 
 
 
325 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  39.18 
 
 
322 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  36.54 
 
 
321 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  34.91 
 
 
329 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  39.72 
 
 
325 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.42 
 
 
326 aa  208  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.98 
 
 
330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  38.31 
 
 
325 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  37.69 
 
 
346 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  37.54 
 
 
326 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  37.65 
 
 
339 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.77 
 
 
335 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  33.99 
 
 
334 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  39.72 
 
 
327 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37.82 
 
 
327 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2820  hypothetical protein  37.46 
 
 
359 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.407557  normal  0.294179 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.85 
 
 
330 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1011  hypothetical protein  37.22 
 
 
395 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630289  normal  0.164657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  41.16 
 
 
336 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  38.44 
 
 
324 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.33 
 
 
356 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  37.3 
 
 
336 aa  205  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  39.2 
 
 
351 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  37.91 
 
 
345 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.21 
 
 
318 aa  205  9e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  37.06 
 
 
323 aa  205  9e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.38 
 
 
331 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  40.93 
 
 
328 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  39.32 
 
 
349 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1427  twin-arginine translocation pathway signal  36.83 
 
 
334 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  39.55 
 
 
326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  36.07 
 
 
335 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1898  hypothetical protein  34.92 
 
 
329 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931279  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1931  hypothetical protein  35.67 
 
 
329 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4085  hypothetical protein  38.83 
 
 
324 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  37.84 
 
 
330 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  37 
 
 
341 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  38.51 
 
 
333 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.21 
 
 
334 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  40.61 
 
 
314 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  37.46 
 
 
331 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5205  extra-cytoplasmic solute receptor  36.51 
 
 
330 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375676  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  36.65 
 
 
327 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>