More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0694 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  100 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  75.39 
 
 		 260 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  75.39 
 
 		 260 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  69.02 
 
 		 283 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  52.57 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  51.78 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  52.73 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  52.34 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  52.34 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  51.78 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  51.78 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  52.34 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  52.34 
 
 		 251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  51.38 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  51.38 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  51.38 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  51.38 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  50.59 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  51.38 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  51.38 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  50.78 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  51.38 
 
 		 253 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  49.8 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  48.62 
 
 		 251 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  48.44 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  48.44 
 
 		 251 aa  258  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  50.7 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  42.86 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  41.11 
 
 		 290 aa  206  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  40.16 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  37.8 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  39.29 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  39.53 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  39.53 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  40.16 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  39.13 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  38.25 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  39.36 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  39.36 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  38.96 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  38.96 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  38.55 
 
 		 262 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  37.35 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  38.55 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  37.07 
 
 		 263 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  40.83 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  32.52 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  31.3 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  28.79 
 
 		 829 aa  122  6e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  31.51 
 
 		 957 aa  122  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  30.37 
 
 		 866 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  28.4 
 
 		 903 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  30.8 
 
 		 885 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  31.47 
 
 		 941 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  32.08 
 
 		 876 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  32.74 
 
 		 480 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  27.65 
 
 		 893 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  29.06 
 
 		 976 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  29.12 
 
 		 891 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 912 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 979 aa  115  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  26.36 
 
 		 903 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  28.73 
 
 		 935 aa  116  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 915 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 978 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  31.76 
 
 		 861 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  30 
 
 		 891 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  28.46 
 
 		 908 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  28.91 
 
 		 866 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 868 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 888 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 896 aa  111  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  29.27 
 
 		 892 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  28.95 
 
 		 992 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  30.2 
 
 		 988 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  27.86 
 
 		 943 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  30.6 
 
 		 877 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  28.91 
 
 		 896 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 861 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  31.98 
 
 		 332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  26.79 
 
 		 931 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  28.46 
 
 		 1022 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 885 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  26.64 
 
 		 892 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  29.8 
 
 		 956 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  26.92 
 
 		 940 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 1024 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  27.04 
 
 		 978 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  26.74 
 
 		 906 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  27.69 
 
 		 924 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  26.25 
 
 		 892 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  31.65 
 
 		 482 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  35 
 
 		 872 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  29.7 
 
 		 891 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  33.79 
 
 		 931 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  30.08 
 
 		 474 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  28.4 
 
 		 944 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  28.64 
 
 		 892 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  30 
 
 		 877 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  29.63 
 
 		 877 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>