More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01189 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  100 
 
 		 260 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  95.77 
 
 		 260 aa  494  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  75.39 
 
 		 257 aa  411  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  77.56 
 
 		 283 aa  401  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  51.97 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  54.51 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  54.12 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  52.94 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  54.12 
 
 		 251 aa  278  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  52.94 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  52.94 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  54.12 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  52.94 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  54.12 
 
 		 251 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  52.94 
 
 		 264 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  52.55 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  52.55 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  52.55 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  52.55 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  52.55 
 
 		 281 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  52.09 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  52.76 
 
 		 253 aa  272  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  52.11 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  51.97 
 
 		 251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  51.57 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  51.57 
 
 		 251 aa  268  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  43.32 
 
 		 290 aa  231  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  54.23 
 
 		 218 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  44.53 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  40.94 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  41.37 
 
 		 252 aa  192  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  41.11 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  40.08 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  40.08 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  41.77 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  41.37 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  41.37 
 
 		 262 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  40.96 
 
 		 262 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  40.96 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  39.37 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  39.2 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  39.06 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  39.04 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  39.04 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  41.89 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  35.11 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  35 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  36.64 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 957 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  33.2 
 
 		 979 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  33.2 
 
 		 978 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 903 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 976 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 940 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 480 aa  131  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 935 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  32.58 
 
 		 941 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  32.16 
 
 		 866 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  32.2 
 
 		 937 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  32.2 
 
 		 937 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  31.66 
 
 		 903 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 891 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  32.92 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  31.03 
 
 		 924 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  30.6 
 
 		 978 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  31.64 
 
 		 912 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  30.12 
 
 		 992 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  30.86 
 
 		 903 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  30.86 
 
 		 903 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  30.98 
 
 		 829 aa  126  4.0000000000000003e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  30.83 
 
 		 891 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  31.06 
 
 		 937 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  30.86 
 
 		 866 aa  124  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  28.68 
 
 		 931 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 892 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 892 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  30.74 
 
 		 895 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  30.68 
 
 		 928 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  30.57 
 
 		 1025 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  28.3 
 
 		 929 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  28.96 
 
 		 903 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  32.14 
 
 		 915 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  30.8 
 
 		 484 aa  122  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  29.64 
 
 		 893 aa  122  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 885 aa  121  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  31.32 
 
 		 945 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 929 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  30.8 
 
 		 932 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  29.06 
 
 		 1032 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 943 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  30.08 
 
 		 892 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  30.86 
 
 		 876 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  31.08 
 
 		 999 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  30.8 
 
 		 1004 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  30.04 
 
 		 906 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  31.41 
 
 		 888 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  30.19 
 
 		 1033 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  30.57 
 
 		 1014 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  31.4 
 
 		 474 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  31.52 
 
 		 482 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>