More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2881 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 263 aa  540  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  40.23 
 
 		 262 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  39.46 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  39.46 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  39.46 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  40.08 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  39.46 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  38.52 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  40.08 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  40.08 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  40.08 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  40.08 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  39.92 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  39.85 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  40.86 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  39.77 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  39.85 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  39.85 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  39.85 
 
 		 251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  39.62 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  39.39 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  39.39 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  39.46 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  39.46 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  38.91 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  39.53 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  39.08 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  39.08 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  38.19 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  38.93 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  38.52 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  38.52 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  39.84 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  38.34 
 
 		 253 aa  169  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  37.96 
 
 		 290 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  39.53 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  37.93 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  37.5 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  37.65 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  38.89 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  37.15 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  37.07 
 
 		 257 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  35.55 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  36.68 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  35.11 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  40.71 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  33.2 
 
 		 265 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  37.78 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 902 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 879 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 896 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  32.95 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  33.6 
 
 		 879 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 892 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  32.17 
 
 		 879 aa  142  8e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 946 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 908 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 951 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  34.25 
 
 		 903 aa  139  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  33.46 
 
 		 850 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 947 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  32.94 
 
 		 896 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  33.59 
 
 		 945 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 903 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 943 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 866 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  34.17 
 
 		 903 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  32.42 
 
 		 879 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  31.76 
 
 		 939 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  34.68 
 
 		 885 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  34.57 
 
 		 931 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  34.17 
 
 		 903 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  29.89 
 
 		 877 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 911 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  33.74 
 
 		 875 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 875 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  29.89 
 
 		 877 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  32.16 
 
 		 905 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 893 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  29.89 
 
 		 877 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  30.4 
 
 		 946 aa  133  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 922 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.98 
 
 		 870 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  31.71 
 
 		 937 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 893 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  31.64 
 
 		 891 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  29.39 
 
 		 939 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  29.52 
 
 		 877 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  33.06 
 
 		 879 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  29.52 
 
 		 877 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  29.52 
 
 		 877 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  32.11 
 
 		 988 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  36.41 
 
 		 938 aa  132  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  33.84 
 
 		 929 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  31.3 
 
 		 937 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  33.07 
 
 		 939 aa  132  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 922 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  35.85 
 
 		 906 aa  131  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 926 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 929 aa  131  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>