More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0420 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  100 
 
 		 283 aa  588  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  78.43 
 
 		 260 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  77.25 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  69.02 
 
 		 257 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  54.05 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  53.7 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  55.51 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  51.32 
 
 		 264 aa  278  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  53.15 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  52.76 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  53.33 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  53.15 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  52.76 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  53.33 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  52.76 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  52.76 
 
 		 251 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  50.76 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  50.76 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  50.76 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  50.76 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  50.76 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  52.71 
 
 		 260 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  51.57 
 
 		 251 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  51.57 
 
 		 251 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  51.57 
 
 		 251 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  51.57 
 
 		 251 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  53.49 
 
 		 218 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  43.73 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  43.12 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  41.9 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  40.56 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  40.56 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  40.16 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  40.56 
 
 		 262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  40.16 
 
 		 262 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  38.58 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  39.04 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  39.04 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  38.04 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  37.89 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  38.31 
 
 		 263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  38 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  37.6 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  37.45 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  36.76 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  36.11 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  41.43 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  31.92 
 
 		 866 aa  132  5e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  31.5 
 
 		 903 aa  123  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  33.18 
 
 		 957 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  33.49 
 
 		 935 aa  122  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  33.47 
 
 		 868 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 829 aa  121  9.999999999999999e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  31.63 
 
 		 891 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 979 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  31.39 
 
 		 912 aa  120  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  33.97 
 
 		 888 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 978 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  32.31 
 
 		 928 aa  119  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 976 aa  119  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  29.67 
 
 		 893 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  28.57 
 
 		 892 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  30.87 
 
 		 988 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  27.34 
 
 		 929 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  32.84 
 
 		 992 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  27.34 
 
 		 929 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  32.26 
 
 		 480 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  29.49 
 
 		 892 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  33.95 
 
 		 861 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  29.62 
 
 		 940 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  29.41 
 
 		 943 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  30.87 
 
 		 956 aa  115  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  35.82 
 
 		 935 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  33.49 
 
 		 951 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  31.67 
 
 		 911 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 941 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  32.38 
 
 		 940 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  29.77 
 
 		 903 aa  115  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  32.08 
 
 		 891 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  30.89 
 
 		 945 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  32.86 
 
 		 978 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 892 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  31.63 
 
 		 937 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  31.63 
 
 		 937 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  31.84 
 
 		 888 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  33.94 
 
 		 872 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  32.14 
 
 		 999 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  28.85 
 
 		 908 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  33.82 
 
 		 968 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  28.09 
 
 		 928 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  31.36 
 
 		 866 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>