More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1002 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  83.94 
 
 		 251 aa  444  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  76.71 
 
 		 264 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  99.5 
 
 		 218 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  75.9 
 
 		 253 aa  407  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  77.11 
 
 		 260 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  74.7 
 
 		 253 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  72.91 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  72.51 
 
 		 251 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  72.91 
 
 		 251 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  72.51 
 
 		 251 aa  390  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  72.51 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  71.08 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  70.92 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  70.92 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  71.08 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  70.52 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  70.92 
 
 		 251 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  71.08 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  71.08 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  71.08 
 
 		 281 aa  384  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  69.08 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  53.12 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  51.57 
 
 		 260 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  51.57 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  48.44 
 
 		 257 aa  258  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  43.31 
 
 		 262 aa  201  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  39.71 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  39.08 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  39.29 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  38.37 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  38.58 
 
 		 252 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  38.49 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  39.76 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  37.6 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  37.4 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  37.2 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  37.45 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  37.45 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  37.2 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  37.2 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  36.8 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  36.8 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  36.25 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  34.84 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.87 
 
 		 850 aa  142  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  37.61 
 
 		 236 aa  141  8e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 931 aa  137  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0459  Exo  33.76 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.454696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  32.54 
 
 		 930 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 929 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 929 aa  135  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 868 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 480 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 934 aa  132  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 932 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 932 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  34.76 
 
 		 935 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 932 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 928 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  30.89 
 
 		 885 aa  129  6e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 978 aa  128  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 976 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 877 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  31.94 
 
 		 928 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  30.86 
 
 		 893 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  32.24 
 
 		 878 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  33.04 
 
 		 888 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  35.07 
 
 		 992 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 988 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  28.63 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  33.61 
 
 		 484 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 928 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 928 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 928 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 928 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 928 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  30.83 
 
 		 892 aa  125  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  32.07 
 
 		 891 aa  125  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  33.21 
 
 		 935 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  34.76 
 
 		 979 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  30.59 
 
 		 956 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 928 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  34.74 
 
 		 876 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  34.74 
 
 		 876 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  32.23 
 
 		 876 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  33.49 
 
 		 940 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  33.65 
 
 		 893 aa  123  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 911 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 903 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>