More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3175 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 253 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  88 
 
 		 253 aa  454  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  80 
 
 		 264 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  81.2 
 
 		 260 aa  420  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  77.29 
 
 		 251 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  75.9 
 
 		 251 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  75.9 
 
 		 251 aa  407  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  72.69 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  72.69 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  72.69 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  72.69 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  72.29 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  72.29 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  72.29 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  72.29 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  72.29 
 
 		 281 aa  385  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  71.49 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  72.29 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  71.08 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  71.08 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  71.08 
 
 		 251 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  71.49 
 
 		 251 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  77.39 
 
 		 218 aa  329  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  52.57 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  53.7 
 
 		 283 aa  278  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  51.97 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  52.76 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  47.71 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  43.37 
 
 		 290 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  42.08 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  42 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  41.04 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  40.8 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  40.71 
 
 		 253 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  40.8 
 
 		 262 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  40.8 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  40.55 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  40.4 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  38.93 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  38.19 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  40.4 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  40.4 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  40.16 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  38.98 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  38.65 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  41.28 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  35.91 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 885 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  34.94 
 
 		 976 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  37.55 
 
 		 484 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 892 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.45 
 
 		 850 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  34.47 
 
 		 992 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 911 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 979 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 978 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 941 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 480 aa  139  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 931 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 885 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  38.43 
 
 		 482 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  31.27 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 978 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  31.69 
 
 		 893 aa  135  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 932 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  32.28 
 
 		 903 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 932 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 932 aa  135  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 929 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  33.71 
 
 		 1004 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.68 
 
 		 888 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 1032 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  33.98 
 
 		 1025 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 957 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  35.86 
 
 		 474 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 892 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  32.82 
 
 		 1021 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 892 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  34.1 
 
 		 928 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 891 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  31.62 
 
 		 930 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  33.2 
 
 		 892 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 1014 aa  131  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 935 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  32.18 
 
 		 929 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  30.38 
 
 		 938 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 968 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 928 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  31.42 
 
 		 903 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  35.39 
 
 		 474 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  32.81 
 
 		 912 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>