More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2776 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  100 
 
 		 262 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  46.35 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  47.71 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  42.86 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  46.12 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  45.7 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  43.73 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  44.19 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  44.53 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  44.19 
 
 		 264 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  45.74 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  43.31 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  43.31 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  41.34 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  41.18 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  42.08 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  39.92 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  39.92 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  39.92 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  40.16 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  42.35 
 
 		 256 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  39.92 
 
 		 251 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  40.16 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  40.16 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  40.16 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  40.16 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  39.53 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  39.53 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  41.7 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  39.92 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  39.53 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  41.7 
 
 		 262 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  41.31 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  39.53 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  41.57 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  40.23 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  41.41 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  41.31 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  41.18 
 
 		 255 aa  188  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  41.41 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  41.41 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  38.43 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  39.22 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  44.93 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  42.73 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  37.55 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  35.18 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  30.33 
 
 		 265 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  30.95 
 
 		 988 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  33.88 
 
 		 1022 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  34.47 
 
 		 908 aa  132  5e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  30.95 
 
 		 956 aa  132  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 861 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  32.05 
 
 		 936 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  30.04 
 
 		 893 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  33.49 
 
 		 892 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  32.52 
 
 		 891 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.74 
 
 		 951 aa  129  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  34.72 
 
 		 903 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 939 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  32.56 
 
 		 829 aa  126  5e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  32.18 
 
 		 896 aa  125  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  30.31 
 
 		 940 aa  125  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 896 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  34.69 
 
 		 944 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  32.43 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  33.95 
 
 		 911 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 903 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  31.45 
 
 		 888 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  30.12 
 
 		 928 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  30.19 
 
 		 929 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  29.2 
 
 		 891 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  31.7 
 
 		 945 aa  119  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 944 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  32.32 
 
 		 982 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  28.52 
 
 		 905 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 937 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  28.91 
 
 		 929 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  32.9 
 
 		 941 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 893 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  29.03 
 
 		 946 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  29.15 
 
 		 937 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  28.3 
 
 		 931 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  32.52 
 
 		 872 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  29.15 
 
 		 937 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  32.27 
 
 		 902 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  34.86 
 
 		 474 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  27.94 
 
 		 932 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  27.94 
 
 		 932 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  31.55 
 
 		 902 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  27.94 
 
 		 932 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  30.49 
 
 		 850 aa  116  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  30.5 
 
 		 979 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 924 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  31.54 
 
 		 976 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  31.68 
 
 		 888 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  29.53 
 
 		 941 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  30.5 
 
 		 978 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  25.48 
 
 		 916 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  32.39 
 
 		 861 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>