More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0234 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  38.65 
 
 		 270 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  37.01 
 
 		 251 aa  175  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.26 
 
 		 903 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 903 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 912 aa  171  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 906 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 934 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 936 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  37.25 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 940 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 896 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  34.25 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  36.47 
 
 		 253 aa  166  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 908 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 899 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 899 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 896 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 947 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  35.69 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  35.91 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 922 aa  163  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 922 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 911 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 927 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 937 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  34.96 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 939 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 957 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 937 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  32.93 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 946 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  33.47 
 
 		 939 aa  155  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 924 aa  155  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.25 
 
 		 941 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 915 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  31.94 
 
 		 902 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  36.82 
 
 		 906 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  39.62 
 
 		 937 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  35.08 
 
 		 942 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  35.08 
 
 		 943 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 907 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 902 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  34.5 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  33.2 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1542  DNA polymerase I  36.58 
 
 		 940 aa  150  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  34.57 
 
 		 910 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 951 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  38.43 
 
 		 936 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 944 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 934 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  37.3 
 
 		 957 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 956 aa  149  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  33.99 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  32.52 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  31.45 
 
 		 988 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 901 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 904 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 885 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 888 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  34 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 891 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 905 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 905 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  32.95 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  30.33 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  33.2 
 
 		 931 aa  145  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  32 
 
 		 928 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  34.26 
 
 		 941 aa  144  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  33.2 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  33.2 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  33.2 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  33.2 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  33.2 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  33.2 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  33.2 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  33.2 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  33.2 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 917 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  34.6 
 
 		 897 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  34.07 
 
 		 923 aa  143  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4612  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 930 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  32.71 
 
 		 892 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  33.06 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 933 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  31.99 
 
 		 903 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  33.09 
 
 		 892 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 926 aa  142  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 908 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 918 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  32.2 
 
 		 892 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  32.55 
 
 		 255 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  32.79 
 
 		 913 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  32.45 
 
 		 893 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>