More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3155 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3155  exonuclease IX  100 
 
 		 218 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1055  exonuclease IX  99.5 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1002  exonuclease IX  99.5 
 
 		 251 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000174167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3802  exonuclease IX  87.06 
 
 		 251 aa  370  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329558  hitchhiker  0.00000392524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3374  exonuclease IX  78.89 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233411  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3175  5'-3' exonuclease  77.39 
 
 		 253 aa  329  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0930  exonuclease IX  78.61 
 
 		 260 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2991  5'-3' exonuclease  76.62 
 
 		 253 aa  324  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3195  exonuclease IX  73.24 
 
 		 251 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.926983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3115  exonuclease IX  77.55 
 
 		 251 aa  321  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.925901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3132  exonuclease IX  77.55 
 
 		 251 aa  321  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.171814 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3295  exonuclease IX  77.04 
 
 		 251 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.609177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3180  exonuclease IX  77.04 
 
 		 251 aa  320  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529886  normal  0.683626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0890  5'-3' exonuclease  75.77 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4062  exonuclease IX  75.77 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0914  exonuclease IX  75.77 
 
 		 251 aa  317  9e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2938  exonuclease IX  75.26 
 
 		 251 aa  315  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.653126  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02643  exonuclease IX  76.04 
 
 		 281 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2942  exonuclease IX  76.04 
 
 		 281 aa  314  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3074  exonuclease IX  76.04 
 
 		 281 aa  314  6e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.256005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02605  hypothetical protein  76.04 
 
 		 281 aa  314  6e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3103  exonuclease IX  76.04 
 
 		 281 aa  314  6e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.28919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3251  exonuclease IX  74.48 
 
 		 264 aa  308  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.143456  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0420  exonuclease IX  53.49 
 
 		 283 aa  228  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000094948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0694  exonuclease IX  50.7 
 
 		 257 aa  224  7e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004248  exodeoxyribonuclease IX  52.36 
 
 		 260 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00525267  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01189  exonuclease IX  50.45 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3538  exonuclease IX  43.84 
 
 		 290 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2776  exonuclease IX  44.93 
 
 		 262 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.147001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2881  5'-3' exonuclease  40.71 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.379054  normal  0.954883 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2558  exonuclease IX  40.58 
 
 		 252 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1289  exonuclease IX  40 
 
 		 262 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0967687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3311  exonuclease IX  39.22 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3460  exonuclease IX  39.5 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0234  DNA polymerase I  36 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.196272  normal  0.294455 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2756  exonuclease IX  39.71 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.172231  normal  0.0671818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2420  exonuclease IX  39.8 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2976  exonuclease IX  39.71 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000898265  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2886  exonuclease IX  37.62 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000113102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1357  exonuclease IX  39.29 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.364747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1396  exonuclease IX  38.78 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285435  hitchhiker  0.00837192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3477  5'-3' exonuclease  37.13 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2716  exonuclease IX  38.31 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2784  exonuclease IX  38.31 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.435309  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2988  exonuclease IX  38.27 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.369035  hitchhiker  0.00000279054 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1371  exonuclease IX  38.27 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.372953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2776  exonuclease IX  37.13 
 
 		 255 aa  128  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 480 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1549  exonuclease IX  38.2 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  36.59 
 
 		 299 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 935 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 979 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 978 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  38.37 
 
 		 482 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 976 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 930 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 937 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 888 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 937 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  34.22 
 
 		 1032 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  35.42 
 
 		 484 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  32.88 
 
 		 992 aa  112  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 940 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 951 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  31.88 
 
 		 1025 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  32.34 
 
 		 988 aa  109  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  31.28 
 
 		 891 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 1021 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  31.82 
 
 		 893 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  34.38 
 
 		 474 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 957 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  32.34 
 
 		 956 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 957 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35 
 
 		 932 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 932 aa  108  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35 
 
 		 932 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35 
 
 		 932 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  34.92 
 
 		 928 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  34.5 
 
 		 931 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 941 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 1010 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 937 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 829 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  36.77 
 
 		 929 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  31.88 
 
 		 1033 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 1014 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 920 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 929 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  33.16 
 
 		 911 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 920 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  34.38 
 
 		 474 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 868 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 944 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  34.83 
 
 		 332 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  31.9 
 
 		 999 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  32.27 
 
 		 1016 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 944 aa  105  4e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  31.07 
 
 		 1022 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  32.27 
 
 		 897 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 891 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>