More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2973 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2973  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 332 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0697  5'-3' exonuclease  48.06 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04579  exodeoxyribonuclease IX  43.57 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2376  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  48.68 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.200429 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2057  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  42.39 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  39.57 
 
 		 938 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 928 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 934 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 930 aa  191  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 934 aa  191  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 893 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  40.56 
 
 		 924 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 926 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 929 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  39.08 
 
 		 935 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 931 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40 
 
 		 903 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  40.56 
 
 		 897 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 928 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 884 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 929 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 897 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 932 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 930 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 932 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 932 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 928 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 897 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 937 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 937 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  38.87 
 
 		 923 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 930 aa  182  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 904 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 973 aa  182  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 951 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 912 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1158  exodeoxyribonuclease IX  37.28 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0177587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  42.29 
 
 		 908 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 913 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 930 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 892 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 936 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  39.66 
 
 		 941 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 937 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 917 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 892 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 888 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 899 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 916 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 934 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 922 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 908 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 921 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 935 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 921 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 921 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 1025 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 939 aa  175  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 940 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 480 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 921 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 978 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 922 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 935 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 929 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 876 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 922 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 922 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 922 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 976 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 899 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 899 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 918 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 931 aa  173  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  35.78 
 
 		 1032 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 1010 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 1033 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 918 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 945 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 906 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 		 933 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  37.59 
 
 		 906 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.08 
 
 		 903 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 891 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>