99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08360 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08360  prenyltransferase and squalene oxidase repeat protein  100 
 
 		 530 aa  1050    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3256  hypothetical protein  50 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  43.98 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  48.28 
 
 		 545 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  43.52 
 
 		 531 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  44.03 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13413  cyclase  29.21 
 
 		 501 aa  110  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5947  hypothetical protein  30.25 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.648457 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01594  conserved hypothetical protein  28.5 
 
 		 979 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.658106  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03252  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  29.55 
 
 		 1091 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09314  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  26.86 
 
 		 928 aa  91.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0823306  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2145  hypothetical protein  29.29 
 
 		 521 aa  91.3  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  30.66 
 
 		 689 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  28.92 
 
 		 598 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  24.81 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  26.92 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 651 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  26.59 
 
 		 631 aa  58.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  27.27 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  25.69 
 
 		 657 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  25.69 
 
 		 657 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  25.69 
 
 		 657 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  26.88 
 
 		 657 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  29.14 
 
 		 667 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  29.01 
 
 		 679 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  26.81 
 
 		 657 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  32.7 
 
 		 663 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  26.67 
 
 		 657 aa  55.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2820  squalene/oxidosqualene cyclase  36.76 
 
 		 618 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2820  Terpene synthase:squalene cyclase  27.16 
 
 		 679 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000869721  normal  0.376933 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  27.23 
 
 		 649 aa  55.5  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  26.17 
 
 		 719 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  21.74 
 
 		 651 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  30.51 
 
 		 695 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  20.13 
 
 		 647 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  25.3 
 
 		 657 aa  53.5  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  30 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  25.82 
 
 		 654 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  29.93 
 
 		 654 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  25.09 
 
 		 653 aa  53.5  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  32.99 
 
 		 684 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  23.84 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  25.82 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  25.4 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  25.45 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  33.01 
 
 		 633 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  32.99 
 
 		 687 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  32.99 
 
 		 687 aa  52.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  25.46 
 
 		 617 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  26.46 
 
 		 669 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  26.13 
 
 		 643 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  26.13 
 
 		 643 aa  52  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1189  squalene-hopene cyclase  25.81 
 
 		 679 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000101315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0062  terpene synthase, squalene cyclase  26.46 
 
 		 656 aa  50.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  27.97 
 
 		 684 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  24.11 
 
 		 617 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  22.9 
 
 		 643 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  28.49 
 
 		 644 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  27.95 
 
 		 640 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  25 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  25 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  25 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  25.84 
 
 		 684 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  36.59 
 
 		 741 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  30.93 
 
 		 678 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  25.79 
 
 		 679 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  24.88 
 
 		 659 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  31.96 
 
 		 678 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2682  squalene cyclase  26.47 
 
 		 654 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145002  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  25 
 
 		 617 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  25.35 
 
 		 663 aa  48.5  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3360  squalene-hopene cyclase  27.22 
 
 		 680 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0001243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0885  squalene-hopene cyclase  27.22 
 
 		 680 aa  47.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000419297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2269  terpene synthase/squalene cyclase  25.4 
 
 		 654 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3582  putative squalene-hopene cyclase  26.5 
 
 		 617 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6347  squalene-hopene cyclase  28.4 
 
 		 663 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.323444  normal  0.123319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0012  Terpene synthase  24.54 
 
 		 678 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131219  normal  0.786968 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2220  squalene-hopene cyclase  29.63 
 
 		 667 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  31.96 
 
 		 682 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5713  squalene-hopene cyclase  34.15 
 
 		 728 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00366399  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0441  squalene-hopene cyclase  24.34 
 
 		 737 aa  47  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1944  squalene-hopene cyclase  29.63 
 
 		 667 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.89702  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0727  squalene-hopene cyclase  21.67 
 
 		 632 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548053  normal  0.146033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  27.64 
 
 		 554 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  30.93 
 
 		 683 aa  46.6  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  24.41 
 
 		 617 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  25.98 
 
 		 617 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  25.76 
 
 		 661 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  34.33 
 
 		 654 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09189  squalene-hopene-cyclase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00260)  24.8 
 
 		 426 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.178014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  26.97 
 
 		 710 aa  43.9  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4261  squalene-hopene cyclase  24.9 
 
 		 653 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>