73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3192 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1078    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3256  hypothetical protein  52.88 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  49.72 
 
 		 545 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  49.35 
 
 		 531 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08360  prenyltransferase and squalene oxidase repeat protein  44.4 
 
 		 530 aa  335  1e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  41 
 
 		 577 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13413  cyclase  29.13 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5947  hypothetical protein  28.28 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.648457 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01594  conserved hypothetical protein  26.6 
 
 		 979 aa  95.5  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.658106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2145  hypothetical protein  28.86 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09314  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  24.85 
 
 		 928 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0823306  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03252  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  24.71 
 
 		 1091 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  33.64 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  33.61 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  31.08 
 
 		 695 aa  58.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  33.57 
 
 		 689 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  30.4 
 
 		 643 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0727  squalene-hopene cyclase  28.89 
 
 		 632 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548053  normal  0.146033 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  29.1 
 
 		 659 aa  54.7  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  32.7 
 
 		 710 aa  54.3  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  28.57 
 
 		 684 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3582  putative squalene-hopene cyclase  30.53 
 
 		 617 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4671  Terpene synthase  27.5 
 
 		 637 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.965623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  34.67 
 
 		 663 aa  52.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  30.77 
 
 		 668 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  30.53 
 
 		 617 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  31.4 
 
 		 679 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  31.85 
 
 		 653 aa  51.2  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  29.47 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  30.4 
 
 		 651 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  30.51 
 
 		 649 aa  50.8  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  31.09 
 
 		 647 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  31.07 
 
 		 645 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  29.47 
 
 		 617 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2820  squalene/oxidosqualene cyclase  32.93 
 
 		 618 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  29.47 
 
 		 617 aa  50.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  29.47 
 
 		 617 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  29.47 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  29.47 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2682  squalene cyclase  36.36 
 
 		 654 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145002  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  30.43 
 
 		 654 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  31.02 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  27.94 
 
 		 730 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  29.46 
 
 		 654 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  30.48 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  27.21 
 
 		 730 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0806  amine oxidase  29 
 
 		 726 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  27.73 
 
 		 679 aa  47.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0062  terpene synthase, squalene cyclase  33.33 
 
 		 656 aa  47  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2269  terpene synthase/squalene cyclase  36.07 
 
 		 654 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  33.67 
 
 		 663 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  35 
 
 		 687 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  35 
 
 		 687 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  32.58 
 
 		 619 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  35 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3360  squalene-hopene cyclase  26.89 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0001243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  28.75 
 
 		 662 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  26.32 
 
 		 617 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  32.29 
 
 		 719 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4261  squalene-hopene cyclase  34.33 
 
 		 653 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942083  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  31.25 
 
 		 678 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  28.49 
 
 		 688 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  31.68 
 
 		 654 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0885  squalene-hopene cyclase  26.89 
 
 		 680 aa  44.3  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000419297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  31.03 
 
 		 644 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  28.12 
 
 		 617 aa  44.3  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  31.51 
 
 		 677 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  33.87 
 
 		 665 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  29.91 
 
 		 741 aa  43.5  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1189  squalene-hopene cyclase  25.45 
 
 		 679 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000101315  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  32.5 
 
 		 683 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  30.17 
 
 		 657 aa  43.5  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1726  squalene cyclase  30.77 
 
 		 654 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00651785  normal  0.158685 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>