103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3256 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3256  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1053    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  52.82 
 
 		 531 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  52.79 
 
 		 545 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  53.48 
 
 		 560 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08360  prenyltransferase and squalene oxidase repeat protein  50 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  43.26 
 
 		 577 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13413  cyclase  28.75 
 
 		 501 aa  120  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01594  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 		 979 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.658106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5947  hypothetical protein  30.54 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.648457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2145  hypothetical protein  28.96 
 
 		 521 aa  93.6  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09314  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  27.33 
 
 		 928 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0823306  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03252  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  29.57 
 
 		 1091 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  28.31 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  36.13 
 
 		 654 aa  58.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  36.67 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  36.11 
 
 		 741 aa  57  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  35.33 
 
 		 663 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  27.78 
 
 		 617 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  30.87 
 
 		 667 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3582  putative squalene-hopene cyclase  31.68 
 
 		 617 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  32.81 
 
 		 679 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  35.9 
 
 		 654 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  33.55 
 
 		 644 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  35.83 
 
 		 645 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  29.29 
 
 		 617 aa  53.5  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  29.65 
 
 		 684 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  31.55 
 
 		 695 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  35.29 
 
 		 662 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  27.16 
 
 		 617 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  29.29 
 
 		 617 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  32.67 
 
 		 617 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  30.89 
 
 		 659 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  29.29 
 
 		 617 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  32.61 
 
 		 653 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1720  squalene cyclase  32.81 
 
 		 654 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0718096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  30 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  33.79 
 
 		 633 aa  52.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  29.38 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  37.37 
 
 		 640 aa  52.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  30.69 
 
 		 617 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  32.2 
 
 		 657 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  29.29 
 
 		 617 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2820  squalene/oxidosqualene cyclase  31.31 
 
 		 618 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2820  Terpene synthase:squalene cyclase  30.46 
 
 		 679 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000869721  normal  0.376933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3360  squalene-hopene cyclase  31.45 
 
 		 680 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0001243  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2220  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 667 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  30.07 
 
 		 678 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  33.59 
 
 		 719 aa  51.2  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  33.06 
 
 		 649 aa  51.2  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1944  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 667 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.89702  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0885  squalene-hopene cyclase  31.45 
 
 		 680 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000419297 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  29.33 
 
 		 643 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1189  squalene-hopene cyclase  32.77 
 
 		 679 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000101315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  23.75 
 
 		 617 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6347  squalene-hopene cyclase  36.36 
 
 		 663 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.323444  normal  0.123319 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  32.33 
 
 		 643 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  32.33 
 
 		 643 aa  50.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4261  squalene-hopene cyclase  39.13 
 
 		 653 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.942083  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2873  squalene cyclase family protein  43.04 
 
 		 670 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  30.77 
 
 		 661 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  30.07 
 
 		 687 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  30.07 
 
 		 687 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  32.32 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3243  squalene-hopene cyclase  34.34 
 
 		 672 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.291091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  26.94 
 
 		 647 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4385  Prenyltransferase/squalene oxidase  38.04 
 
 		 560 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  26.94 
 
 		 651 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  30.72 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  29.41 
 
 		 683 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 657 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 651 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 651 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  29.14 
 
 		 679 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  30.72 
 
 		 678 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  32.58 
 
 		 657 aa  47.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 657 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  33.64 
 
 		 684 aa  47.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  47  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  32.48 
 
 		 657 aa  47  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0012  Terpene synthase  33.05 
 
 		 678 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131219  normal  0.786968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1726  squalene cyclase  40.3 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00651785  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2682  squalene cyclase  33.33 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145002  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  31.09 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  28.83 
 
 		 684 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  29.33 
 
 		 668 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  31.91 
 
 		 730 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4079  squalene-hopene cyclase  35.35 
 
 		 654 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  37.31 
 
 		 598 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  31.18 
 
 		 730 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0903  Squalene cyclase-like protein  31.65 
 
 		 697 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  28.86 
 
 		 688 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  32.56 
 
 		 663 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5713  squalene-hopene cyclase  33.03 
 
 		 728 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00366399  normal  0.682712 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>