59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1288 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1031    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3256  hypothetical protein  52.28 
 
 		 531 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  50.58 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  49.16 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08360  prenyltransferase and squalene oxidase repeat protein  43.52 
 
 		 530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  40.14 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13413  cyclase  27.54 
 
 		 501 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5947  hypothetical protein  30.59 
 
 		 520 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.648457 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09314  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  27.36 
 
 		 928 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0823306  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2145  hypothetical protein  27.83 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01594  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 		 979 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.658106  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03252  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  29.21 
 
 		 1091 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  32 
 
 		 657 aa  53.9  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  28.82 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  30.82 
 
 		 631 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  31.37 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  29.89 
 
 		 710 aa  52  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  30.17 
 
 		 647 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  32.08 
 
 		 695 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  30.46 
 
 		 651 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  39.51 
 
 		 677 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  35.65 
 
 		 645 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 654 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  32.23 
 
 		 669 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  26.02 
 
 		 643 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 651 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 689 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4079  squalene-hopene cyclase  30.77 
 
 		 654 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342218 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 651 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 657 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  28.77 
 
 		 661 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  30.47 
 
 		 657 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0727  squalene-hopene cyclase  31.06 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548053  normal  0.146033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  30.47 
 
 		 657 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  31.3 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2269  terpene synthase/squalene cyclase  38.46 
 
 		 654 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  37.14 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  30.57 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 663 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  35.71 
 
 		 657 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  35.71 
 
 		 657 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  35.71 
 
 		 657 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_645  acetyl-coenzyme A synthetase  26.36 
 
 		 682 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.756147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  27.91 
 
 		 659 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  31.3 
 
 		 598 aa  44.3  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7029  squalene-hopene cyclase  29.69 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000008735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2682  squalene cyclase  38.46 
 
 		 654 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  27.17 
 
 		 619 aa  44.3  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  29.84 
 
 		 668 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  30.88 
 
 		 662 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  33.71 
 
 		 665 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2873  squalene cyclase family protein  33.58 
 
 		 670 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  32.05 
 
 		 679 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  31.36 
 
 		 678 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  35.71 
 
 		 657 aa  43.9  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>