89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3710 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1132    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08360  prenyltransferase and squalene oxidase repeat protein  44.5 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3256  hypothetical protein  43.62 
 
 		 531 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  43.49 
 
 		 545 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  40.79 
 
 		 531 aa  311  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  40.45 
 
 		 560 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13413  cyclase  28.41 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5947  hypothetical protein  31.26 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.648457 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01594  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 979 aa  86.7  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.658106  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09314  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  27.59 
 
 		 928 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0823306  normal  0.708956 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03252  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  26.61 
 
 		 1091 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2145  hypothetical protein  26.91 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  32.5 
 
 		 689 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3320  squalene/oxidosqualene cyclase  26.19 
 
 		 643 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  35.04 
 
 		 631 aa  58.2  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  36.46 
 
 		 640 aa  54.3  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  33.33 
 
 		 741 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  28.85 
 
 		 643 aa  53.5  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  28.85 
 
 		 643 aa  53.5  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  27.66 
 
 		 695 aa  53.5  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3315  squalene-hopene cyclase  29.08 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  33.04 
 
 		 662 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02520  lanosterol synthase, putative  30.71 
 
 		 738 aa  51.6  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0688  squalene-hopene cyclase  29.46 
 
 		 679 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0586149  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  29.01 
 
 		 687 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  29.01 
 
 		 687 aa  51.6  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  26.64 
 
 		 619 aa  51.2  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  30 
 
 		 651 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3351  squalene-hopene cyclase  29.08 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.869066  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  29.68 
 
 		 669 aa  51.2  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3612  squalene-hopene cyclase  29.08 
 
 		 617 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  27.82 
 
 		 647 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3175  squalene-hopene cyclase  30.17 
 
 		 657 aa  50.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4954  Terpene synthase:squalene cyclase  40.32 
 
 		 673 aa  50.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  29.49 
 
 		 659 aa  50.4  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  26.98 
 
 		 719 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3265  squalene-hopene cyclase  28.37 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  29.01 
 
 		 678 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3565  putative squalene-hopene cyclase  28.37 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.143016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1652  putative squalene-hopene cyclase  26.95 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.155844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  29.88 
 
 		 644 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  28.4 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3260  squalene/oxidosqualene cyclase  26.11 
 
 		 617 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3572  squalene-hopene cyclase  26.95 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  30.3 
 
 		 682 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  24.24 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3665  putative squalene-hopene cyclase  23.77 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  26.62 
 
 		 657 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2100  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 651 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1490  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 651 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3275  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1355  squalene-hopene cyclase  25.88 
 
 		 684 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.06763 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  38.57 
 
 		 649 aa  48.5  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0727  squalene-hopene cyclase  28.89 
 
 		 632 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548053  normal  0.146033 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1409  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.525884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1129  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2394  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3161  squalene-hopene cyclase  27.45 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3582  putative squalene-hopene cyclase  26.95 
 
 		 617 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  30.12 
 
 		 683 aa  48.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  26.11 
 
 		 710 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  27.1 
 
 		 645 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2820  squalene/oxidosqualene cyclase  30.3 
 
 		 618 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5679  squalene-hopene cyclase  29.06 
 
 		 657 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126345  hitchhiker  0.00244558 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5180  squalene cyclase  29.06 
 
 		 657 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0421505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  28.57 
 
 		 730 aa  47.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2756  prenyltransferase/squalene oxidase  32.56 
 
 		 554 aa  47.4  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4556  squalene-hopene cyclase  29.06 
 
 		 657 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282201  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  33.62 
 
 		 633 aa  47  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0903  Squalene cyclase-like protein  36.96 
 
 		 697 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  29.2 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  26.11 
 
 		 598 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4079  squalene-hopene cyclase  30.72 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  29.17 
 
 		 661 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3573  squalene cyclase  28.07 
 
 		 654 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2359  squalene-hopene cyclase  26.95 
 
 		 657 aa  46.2  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  29.25 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4385  Prenyltransferase/squalene oxidase  34.23 
 
 		 560 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  29.25 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4137  squalene-hopene cyclase  34.72 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  26.62 
 
 		 653 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0019  Terpene synthase/squalene cyclase  27.78 
 
 		 657 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1825  squalene-hopene cyclase  27.82 
 
 		 663 aa  44.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0441  squalene-hopene cyclase  28.83 
 
 		 737 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1020  squalene-hopene cyclase  24.17 
 
 		 679 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111507  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0525  cycloartenol synthase-like protein  28.21 
 
 		 392 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  41.54 
 
 		 1664 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  31.25 
 
 		 688 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  32.08 
 
 		 730 aa  43.5  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>