14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0525 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0525  cycloartenol synthase-like protein  100 
 
 
392 aa  806    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2435  cycloartenol synthase-like protein  45.36 
 
 
385 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1815  cycloartenol synthase-like protein  46.41 
 
 
385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4048  cycloartenol synthase-like protein  35.67 
 
 
348 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2604  signal peptide-containing protein  35.18 
 
 
382 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1752  hypothetical protein  24.23 
 
 
348 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0554634  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6441  hypothetical protein  26.37 
 
 
522 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2003  hypothetical protein  23.82 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0341062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0829  hypothetical protein  22.33 
 
 
497 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_645  acetyl-coenzyme A synthetase  29.85 
 
 
682 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.756147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0306  A-macroglobulin complement component  21.86 
 
 
827 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1146  hypothetical protein  22.09 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.837479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  39.68 
 
 
689 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  24.14 
 
 
695 aa  43.5  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>