60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2145 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2145  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1071    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5947  hypothetical protein  31.37 
 
 		 520 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.648457 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13413  cyclase  28.93 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3256  hypothetical protein  28.81 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  27.83 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08360  prenyltransferase and squalene oxidase repeat protein  29.72 
 
 		 530 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3808  hypothetical protein  30.02 
 
 		 545 aa  94.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01594  conserved hypothetical protein  24.91 
 
 		 979 aa  93.6  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.658106  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03252  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  26.27 
 
 		 1091 aa  90.5  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09314  terpene synthase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G15060)  24.78 
 
 		 928 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0823306  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  26.95 
 
 		 577 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  27.88 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4758  squalene-hopene cyclase  33.33 
 
 		 689 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1835  squalene-hopene cyclase  31.35 
 
 		 667 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23080  squalene-hopene cyclase  29.11 
 
 		 640 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  normal  0.224628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4671  Terpene synthase  25.17 
 
 		 637 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.965623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2443  squalene-hopene cyclase  29.67 
 
 		 631 aa  52.8  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.78759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1740  squalene cyclase  24.5 
 
 		 657 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0812  squalene-hopene cyclase  30.95 
 
 		 654 aa  50.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.158231  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7146  squalene-hopene cyclase  32.26 
 
 		 663 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0355  squalene-hopene cyclase  26.51 
 
 		 695 aa  50.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5491  squalene-hopene cyclase  26.37 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.264934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2220  squalene-hopene cyclase  36 
 
 		 667 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2124  squalene-hopene cyclase  36.84 
 
 		 643 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1783  squalene-hopene cyclase  36.84 
 
 		 643 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1944  squalene-hopene cyclase  36 
 
 		 667 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.89702  normal  0.562676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3061  squalene-hopene cyclase  25.88 
 
 		 730 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.299317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5426  squalene-hopene cyclase  33.04 
 
 		 665 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5992  squalene-hopene cyclase  37.93 
 
 		 683 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.234824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0419  Terpene synthase:squalene cyclase  26.09 
 
 		 730 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1697  squalene-hopene cyclase  40.48 
 
 		 633 aa  48.1  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.633147  hitchhiker  0.000255993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  27.44 
 
 		 659 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6104  squalene-hopene cyclase  37.93 
 
 		 682 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.640777  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1989  squalene-hopene cyclase  27.35 
 
 		 710 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6347  squalene-hopene cyclase  33.94 
 
 		 663 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.323444  normal  0.123319 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5865  squalene-hopene cyclase  43.55 
 
 		 678 aa  47.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2232  squalene/oxidosqualene cyclase  31.62 
 
 		 619 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6664  squalene-hopene cyclase  26.73 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2842  squalene/oxidosqualene cyclase  26.16 
 
 		 647 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2736  squalene-hopene cyclase  28.47 
 
 		 688 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6546  squalene-hopene cyclase  38.89 
 
 		 684 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6062  squalene-hopene cyclase  25 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7519  Terpene synthase/squalene cyclase  36.67 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5698  squalene cyclase  25 
 
 		 687 aa  46.2  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20760  squalene-hopene cyclase  26.47 
 
 		 598 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.577107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3254  squalene-hopene cyclase  25.96 
 
 		 651 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2233  squalene-hopene cyclase  29.57 
 
 		 684 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000414929  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3575  squalene/oxidosqualene cyclase  24.58 
 
 		 668 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0823  squalene cyclase  34.72 
 
 		 741 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.671451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4954  Terpene synthase:squalene cyclase  27.17 
 
 		 673 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4403  Squalene cyclase  26.51 
 
 		 661 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122673  normal  0.247773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2820  Terpene synthase:squalene cyclase  29.03 
 
 		 679 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000869721  normal  0.376933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2556  squalene cyclase  29.93 
 
 		 653 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0441  squalene-hopene cyclase  26.87 
 
 		 737 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5713  squalene-hopene cyclase  30.56 
 
 		 728 aa  43.9  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00366399  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1685  squalene-hopene cyclase  30.32 
 
 		 649 aa  43.5  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4148  squalene-hopene cyclase  31.06 
 
 		 669 aa  43.5  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146424  normal  0.598571 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0765  squalene-hopene cyclase  27.54 
 
 		 719 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000268109  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0062  terpene synthase, squalene cyclase  29.22 
 
 		 656 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3156  squalene-hopene cyclase  31.47 
 
 		 662 aa  43.5  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>