More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3105 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3105  flagellin modification protein A  100 
 
 
252 aa  517  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.566927  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1577  flagellin modification protein A  77.78 
 
 
252 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1974  flagellin modification protein A  55.56 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  43.19 
 
 
256 aa  223  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
261 aa  198  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  38.91 
 
 
256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01141  flagellin modification protein A  38.43 
 
 
260 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.667394 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0377  flagellin modification protein A  36.33 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1228  flagellin modification protein A  36.19 
 
 
254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472207  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14121  flagellin modification protein A  36.82 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1521  flagellin modification protein A  36.96 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
267 aa  129  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  31.78 
 
 
266 aa  126  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
274 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
256 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 
273 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
259 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  28.85 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
278 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1352  putative oxidoreductase  27.55 
 
 
271 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0380905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
248 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0423365  hitchhiker  0.00643231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 
264 aa  89.4  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5385  short chain dehydrogenase  26.54 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.678355  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.08 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  25.47 
 
 
259 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.5 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.611313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4208  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  27 
 
 
248 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1097  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  27 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  28.57 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2236  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.76 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0079693  hitchhiker  0.0000000000146791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  26.15 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.3 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.47 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.1 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  26.85 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  24.11 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.9 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.56 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1150  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.78 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.92 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.83 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.126058  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  25 
 
 
255 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.52 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.3 
 
 
251 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1563  short-chain alcohol dehydrogenase  23.28 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147181  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3720  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0906259  normal  0.2081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
282 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0692729  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3615  putative dehydrogenase  26.25 
 
 
291 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.427411  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 
251 aa  77.8  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.49838  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4559  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.1 
 
 
245 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3804  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.101152 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.17 
 
 
255 aa  77  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.37 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  25.67 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.77 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.48 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.39 
 
 
280 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.82 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.52 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3532  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.07 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0524  short chain dehydrogenase  27.17 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.87 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.303734  normal  0.393919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3838  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0844914  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.27 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.67 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0330  sorbitol dehydrogenase  24.24 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.264194  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2462  sorbitol dehydrogenase  24.24 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0628  sorbitol dehydrogenase  24.24 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>