More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0412 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
273 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
273 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
274 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
270 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  35.32 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
265 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1352  putative oxidoreductase  33.71 
 
 
271 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0380905  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
270 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
262 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  30.19 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  27.17 
 
 
256 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
256 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
258 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
259 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710312  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
248 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
251 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  29.67 
 
 
259 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.57 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17930  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.25 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.481868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  28.52 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.21 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.13 
 
 
255 aa  110  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.77 
 
 
251 aa  109  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  30.51 
 
 
260 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.09 
 
 
246 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 
255 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  34.43 
 
 
254 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
254 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
253 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  28.77 
 
 
258 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01141  flagellin modification protein A  26.84 
 
 
260 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.667394 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
263 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
251 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
251 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  31.14 
 
 
249 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1521  flagellin modification protein A  26.89 
 
 
256 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.27 
 
 
249 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  28.47 
 
 
253 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
266 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.34 
 
 
246 aa  105  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  26.84 
 
 
256 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  30.88 
 
 
254 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
256 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.94 
 
 
256 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
255 aa  105  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
253 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
252 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
253 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  31.16 
 
 
261 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.74 
 
 
244 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
257 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0377  flagellin modification protein A  26.89 
 
 
256 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
257 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1577  flagellin modification protein A  26.69 
 
 
252 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
261 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 
283 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.419965  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  29.41 
 
 
251 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.55 
 
 
274 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138252  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.04 
 
 
259 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 
249 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.57 
 
 
258 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  27.57 
 
 
258 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
253 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.99 
 
 
264 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
258 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
262 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
252 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2355  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.82 
 
 
288 aa  103  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
254 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.88 
 
 
262 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.28 
 
 
278 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5289  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
263 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0559291  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  27.14 
 
 
257 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 
256 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 
256 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
256 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  29.78 
 
 
256 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
251 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  31.9 
 
 
266 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05760  glucose 1-dehydrogenase, putative  29.82 
 
 
259 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0117369  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
255 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 
255 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.32 
 
 
255 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3105  flagellin modification protein A  25.91 
 
 
252 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.566927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>