More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1893 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 259 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  41.54 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.09 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.07 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  31.25 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  30.5 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.68 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  29.48 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1953  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 2081 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.272599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  29.74 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.23 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 270 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 273 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  30.83 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0377  flagellin modification protein A  29.07 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01141  flagellin modification protein A  29.01 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.667394 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1521  flagellin modification protein A  28.29 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 254 aa  111  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 253 aa  111  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  26.97 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  31.18 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  29.32 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  31.75 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  31.32 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6443  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.246968  normal  0.169503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.05 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.59 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  30.92 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  29.92 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  29.81 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  29.28 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  30.08 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1228  flagellin modification protein A  28.19 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472207  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  29.1 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  30.04 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 257 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.78 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  29.81 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  29.28 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.94 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  29.06 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20270  beta-ketoacyl reductase  31.2 
 
 		 256 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.483952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1974  flagellin modification protein A  29.07 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.73 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  28.79 
 
 		 256 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.76 
 
 		 248 aa  105  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3604  putative dehydrogenase  32.05 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.15 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.01 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05637  short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_4G13550)  29.32 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.35699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  29.69 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7115  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1577  flagellin modification protein A  29.84 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3705  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.551214  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000369604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.63 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.57 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686827  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.36 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0736  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.16 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00191984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  28.95 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3105  flagellin modification protein A  30.15 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.566927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  28.68 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  27.97 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.9 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0598  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.5 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  29.32 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>