More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1228 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1228  flagellin modification protein A  100 
 
 
254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472207  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0377  flagellin modification protein A  68.75 
 
 
256 aa  371  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1521  flagellin modification protein A  67.97 
 
 
256 aa  364  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  46.69 
 
 
256 aa  236  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  45.14 
 
 
256 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01141  flagellin modification protein A  39.61 
 
 
260 aa  192  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.667394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1974  flagellin modification protein A  40.31 
 
 
252 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1577  flagellin modification protein A  37.35 
 
 
252 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3105  flagellin modification protein A  36.19 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.566927  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
261 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14121  flagellin modification protein A  35.97 
 
 
252 aa  148  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
270 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  30.15 
 
 
266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
267 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.77 
 
 
244 aa  111  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
259 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
270 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
262 aa  105  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.62 
 
 
248 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
265 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2742  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.02 
 
 
246 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  30.08 
 
 
254 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
266 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.69 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.63 
 
 
255 aa  99  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.69 
 
 
246 aa  98.6  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
240 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.22369  normal  0.419134 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  28.84 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  28.84 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  28.84 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.09 
 
 
273 aa  92  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
258 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.28 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
261 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.74 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.52 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.348466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.95 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
274 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.85 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.3 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.1 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 
268 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.64 
 
 
239 aa  89.4  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3531  putative short-chain dehydrogenase  24.7 
 
 
256 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138901  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
262 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.8 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1953  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.11 
 
 
269 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  hitchhiker  0.0000443121 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0018  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  27.76 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.88 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0229  pteridine reductase  28.78 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  28.52 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
255 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  28.14 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.15 
 
 
262 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  25.09 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.19 
 
 
257 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
250 aa  86.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
251 aa  85.9  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.42 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.82 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.82 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.82 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.82 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.82 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0345  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.59 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
253 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.15 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.44 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.63 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.44 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.22 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.15 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1744  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.63 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.97 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.35 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9206  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  25.78 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.42 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.59 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  28 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  27.65 
 
 
253 aa  83.2  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.34 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.08 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>