More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2846 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.97 
 
 
274 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1352  putative oxidoreductase  48.33 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0380905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.19 
 
 
273 aa  231  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  40.81 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.85 
 
 
278 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
265 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
270 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
262 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
267 aa  156  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  35.29 
 
 
260 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.56 
 
 
257 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.13 
 
 
258 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
255 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
251 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  34.32 
 
 
259 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  36.88 
 
 
259 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  28.46 
 
 
256 aa  143  4e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  34.4 
 
 
266 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.88 
 
 
255 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
257 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
251 aa  138  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 
253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2791  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
256 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.14 
 
 
257 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2835  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
256 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2818  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
256 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  32.49 
 
 
253 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.07 
 
 
249 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
255 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  34.17 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  31.06 
 
 
256 aa  133  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
258 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  33.09 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
262 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
257 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
257 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
266 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.483374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.58 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.58 
 
 
250 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.36 
 
 
258 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.57 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  34.64 
 
 
267 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0641  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  33.82 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.96 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2538  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.32 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  32.13 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
252 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
253 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.25 
 
 
267 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
255 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.88 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  30.43 
 
 
252 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
255 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
257 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3604  putative dehydrogenase  33.09 
 
 
281 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055827  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12873  short chain dehydrogenase  32.47 
 
 
258 aa  125  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
256 aa  125  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.3 
 
 
252 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  31.99 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
256 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
262 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  32.47 
 
 
264 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  32.36 
 
 
257 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.69 
 
 
253 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3280  short chain dehydrogenase  35.4 
 
 
257 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  34.3 
 
 
253 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2383  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32 
 
 
253 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
275 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
256 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
264 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
270 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.23 
 
 
249 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.84 
 
 
254 aa  122  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.21 
 
 
251 aa  122  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>