More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3280 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3280  short chain dehydrogenase  100 
 
 
257 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0870  short chain dehydrogenase  51.38 
 
 
262 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  45.02 
 
 
254 aa  201  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4577  short chain dehydrogenase  44.84 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4960  short chain dehydrogenase  44.84 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599873  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4665  short chain dehydrogenase  44.84 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1601  short chain dehydrogenase  44.62 
 
 
253 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786043  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
249 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10784  short chain dehydrogenase  43.43 
 
 
248 aa  180  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.95 
 
 
252 aa  162  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
262 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
255 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
256 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  41.37 
 
 
252 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
256 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
256 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
256 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.87 
 
 
249 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  39.38 
 
 
256 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.26 
 
 
255 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1624  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
256 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0419778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  38.76 
 
 
263 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.71 
 
 
256 aa  149  5e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
245 aa  148  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
249 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
265 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000369604  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
255 aa  148  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0357  putative short-chain dehydrogenase  41.67 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0963856  hitchhiker  0.00000797271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.38 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.82 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
259 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
262 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251558  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
259 aa  145  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  36.54 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.22 
 
 
258 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.74 
 
 
258 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3781  sorbitol dehydrogenase  39.23 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.360615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  34.24 
 
 
263 aa  144  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3838  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
272 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0844914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
275 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0935  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.61 
 
 
251 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3369  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.61 
 
 
251 aa  144  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.589225 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
254 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0987  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.61 
 
 
251 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.95 
 
 
247 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  39.92 
 
 
263 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  34.9 
 
 
254 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
255 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.22 
 
 
258 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
253 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
250 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_642  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
265 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.22 
 
 
259 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
273 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2129  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.23 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0736  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.88 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00191984  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3871  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.4 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
256 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4924  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
267 aa  139  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  39.36 
 
 
256 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  36.88 
 
 
259 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.08 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.08 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  37.07 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.08 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
252 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  138  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
248 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
275 aa  138  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  40.08 
 
 
263 aa  138  7e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.71 
 
 
262 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  33.73 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4841  sorbitol dehydrogenase  39 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  138  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  33.73 
 
 
254 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4321  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0121776  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.97 
 
 
250 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4571  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
261 aa  137  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.458297  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20330  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
281 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
257 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.63 
 
 
258 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  36.61 
 
 
250 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5663  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.82 
 
 
251 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363313  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
260 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
255 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000026464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  39.29 
 
 
261 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  33.6 
 
 
254 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>