More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1974 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1974  flagellin modification protein A  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1577  flagellin modification protein A  60.32 
 
 
252 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3105  flagellin modification protein A  55.56 
 
 
252 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.566927  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  49.06 
 
 
256 aa  244  9e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  37.84 
 
 
256 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01141  flagellin modification protein A  37.2 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.667394 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
261 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1228  flagellin modification protein A  40.31 
 
 
254 aa  180  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472207  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0377  flagellin modification protein A  36.19 
 
 
256 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1521  flagellin modification protein A  36.19 
 
 
256 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14121  flagellin modification protein A  36.47 
 
 
252 aa  156  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  29.84 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
270 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
259 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.14 
 
 
265 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.12 
 
 
267 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.51 
 
 
273 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.41 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
262 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.87 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0423365  hitchhiker  0.00643231 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1352  putative oxidoreductase  28.14 
 
 
271 aa  88.6  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0380905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.8 
 
 
256 aa  85.5  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
274 aa  85.1  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  28.08 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.67 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0497593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.93 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2709  oxidoreductase  27.13 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.370968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.06 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.70228  normal  0.023925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.69 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04691  D-arabinitol dehydrogenase (EC 1.1.1.250) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L8]  34.39 
 
 
358 aa  73.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  27.1 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.576946  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  27.1 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  24.71 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.34 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  25.19 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.678355  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  25.84 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  26.42 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4641  short chain dehydrogenase  26.59 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.299413  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4509  short chain dehydrogenase  26.59 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.75 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  26.72 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0339  short chain dehydrogenase  24.9 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1308  short chain dehydrogenase  26.32 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480054  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.686314  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01677  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08710)  28.2 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4208  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  26.72 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  27.48 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.66 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.27 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.67 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2299  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.42 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5343  carbonyl reductase  26.64 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00130  conserved hypothetical protein  26.84 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.63 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  25.19 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1230  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 
240 aa  69.3  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.22369  normal  0.419134 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1097  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  27.1 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2492  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  26.32 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.92 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.13092  normal  0.0162871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  25.94 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.48 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  24.71 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.63 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0197  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  21.84 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.31 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1953  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  24.73 
 
 
269 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.660502  hitchhiker  0.0000443121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  26.24 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  25.66 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  24.8 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.59 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.05 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  22.61 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.98 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.52 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.74 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  23.75 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4234  short chain dehydrogenase  22.81 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.12 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.170949  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.52 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.863798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.19 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1655  short chain dehydrogenase  25.37 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0365832  normal  0.0290451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>