More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5778 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3717  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00704211  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0258116  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
255 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
253 aa  141  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
252 aa  139  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0299657  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
250 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1509  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
251 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419591  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02320  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.278607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
256 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2853  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 
249 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
246 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.61736  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.31 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
251 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
252 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6823  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
246 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.22 
 
 
246 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
255 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0314818  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2910  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.63 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.26924  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.03 
 
 
249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4222  putative Levodione reductase  35.2 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.55 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.98 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
247 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
255 aa  126  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4933  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
249 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.504822  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
252 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  32.81 
 
 
253 aa  125  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.14 
 
 
252 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
253 aa  125  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
249 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
256 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
260 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2581  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
263 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 
252 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
249 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
258 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2421  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
259 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
244 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4948  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
250 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  34.82 
 
 
251 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1050  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
249 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0619  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.43 
 
 
282 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.7915  normal  0.0642608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
249 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.87 
 
 
252 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
248 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
263 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2562  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
263 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
249 aa  123  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2712  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
263 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1253  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
263 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0560735 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0427  sorbitol dehydrogenase  33.99 
 
 
256 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.279316  normal  0.619878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
249 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2798  short chain dehydrogenase  33.07 
 
 
263 aa  123  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
253 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410481  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.48 
 
 
252 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
249 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1003  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.44 
 
 
249 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
262 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
247 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2568  short chain dehydrogenase  34.15 
 
 
251 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459864  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1871  short chain dehydrogenase  34.88 
 
 
264 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.41 
 
 
250 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.14 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 
248 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0999  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.29 
 
 
249 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
255 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02326  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1835  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
244 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.686329  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0968  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.92 
 
 
255 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02287  hypothetical protein  32.68 
 
 
263 aa  122  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  121  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3656  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
263 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  31.84 
 
 
249 aa  121  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
249 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  35.54 
 
 
262 aa  121  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.47 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.544133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>