More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4196 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0591  putative short-chain dehydrogenase/reductase  56.98 
 
 
266 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362399  normal  0.333466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.11 
 
 
270 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.4 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0314818  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
263 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.544133  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
257 aa  168  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.06 
 
 
250 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
250 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
252 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.83 
 
 
247 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.17 
 
 
246 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
257 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3299  hypothetical protein  38.55 
 
 
257 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982919  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2616  short chain dehydrogenase  42.52 
 
 
258 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
257 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0258116  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
254 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.92 
 
 
249 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.44 
 
 
246 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
254 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.89 
 
 
252 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  38.52 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
252 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.22334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
262 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.25 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.73 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  38.46 
 
 
254 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
251 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2567  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.5 
 
 
252 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  42.41 
 
 
258 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.97 
 
 
249 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
252 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0299657  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
254 aa  149  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
253 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 
254 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
262 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2351  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
252 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.647461  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
246 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
252 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.74 
 
 
250 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
246 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38 
 
 
255 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
252 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
268 aa  148  9e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1738  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
251 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.390803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1758  hypothetical protein  38.98 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.522329  normal  0.0728091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.49 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
258 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
252 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.621886  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.99 
 
 
245 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.3 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6883  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
277 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.3 
 
 
246 aa  145  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.34 
 
 
247 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1010  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.28 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.05 
 
 
248 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
272 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3531  putative short-chain dehydrogenase  38.87 
 
 
256 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138901  normal  0.0443196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
252 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.78 
 
 
249 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
259 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
259 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
259 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.77 
 
 
246 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  41.25 
 
 
259 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  40.77 
 
 
259 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
276 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3076  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
285 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  37.01 
 
 
254 aa  143  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.27 
 
 
262 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
260 aa  142  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
265 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  40.86 
 
 
269 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
254 aa  142  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
255 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
247 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
250 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2106  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 
257 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.077628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>