More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14121 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14121  flagellin modification protein A  100 
 
 
252 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.200573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01141  flagellin modification protein A  41.92 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.667394 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1577  flagellin modification protein A  37.65 
 
 
252 aa  181  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0603  flagellin modification protein A  36.14 
 
 
256 aa  180  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3105  flagellin modification protein A  36.82 
 
 
252 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.566927  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2298  flagellin modification protein A  36.08 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.970759  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124891  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1974  flagellin modification protein A  36.47 
 
 
252 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.793496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0377  flagellin modification protein A  35.29 
 
 
256 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1521  flagellin modification protein A  34.9 
 
 
256 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1228  flagellin modification protein A  35.97 
 
 
254 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472207  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1139  short-chain alcohol dehydrogenase-like protein  30.5 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2393  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.62 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1577  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.24 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.240015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 
273 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.92 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0412  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.61 
 
 
278 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1352  putative oxidoreductase  28.73 
 
 
271 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0380905  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0669  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.2 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.154574  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.06 
 
 
274 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0176  short chain dehydrogenase  25.87 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7060  short chain dehydrogenase  25.48 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0344  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.39 
 
 
273 aa  85.1  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.54 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.11 
 
 
256 aa  83.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2646  phosphatidylserine decarboxylase  26.02 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229989  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  26.52 
 
 
261 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2821  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0374  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  24.91 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.333975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.36 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.79 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.280666  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.35 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.10295  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07128  conserved hypothetical protein  25.99 
 
 
275 aa  79  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00131023  normal  0.0770254 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  25.19 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.58 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17790  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  24.34 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.40467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.79 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3706  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.66 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.283086  normal  0.654023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.54 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336427  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1958  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.97 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.29 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.56 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.3 
 
 
255 aa  75.5  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.72 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.78 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.71 
 
 
254 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4263  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.64 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.07 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0956  short chain dehydrogenase  25.58 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.98 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  25.38 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0489  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1271  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  26.01 
 
 
260 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.668655  normal  0.576279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1787  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.37 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1106  short chain dehydrogenase  26.25 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.179926  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  23.94 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0972  putative short-chain dehydrogenase/reductase  25.44 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000126906  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0566  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.92 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  25.38 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9206  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  25.2 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.341088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.966986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1838  short chain dehydrogenase  24.03 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.149837  normal  0.135144 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.86 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.18 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.43 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4102  short chain dehydrogenase  25.47 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.31 
 
 
260 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1496  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.59 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22070  short chain dehydrogenase  23.57 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6224  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.91 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000552131  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1363  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.14 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  27.52 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7112  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.98 
 
 
248 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
253 aa  72  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1526  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  24.54 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  23.55 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  25 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.59 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.46 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>