More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2099 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2099  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.31 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.234758  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.7 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4190  D-mannonate oxidoreductase  44.49 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.203322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3723  D-mannonate oxidoreductase  47.99 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1673  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0896711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.96 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3914  D-mannonate oxidoreductase  46.49 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  0.041983 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0703  D-mannonate oxidoreductase  41.01 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0080  D-mannonate oxidoreductase  50.63 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.768044  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1598  D-mannonate oxidoreductase  38.77 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00242359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2698  D-mannonate oxidoreductase  41.41 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2265  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.18 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.13 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  37.36 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.08 
 
 		 255 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.64 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  36.84 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  36.8 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  35.34 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.61 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  34.69 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0222  gluconate 5-dehydrogenase  36.88 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  34.69 
 
 		 262 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0441  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 		 270 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1470  gluconate 5-dehydrogenase  35.74 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1576  gluconate 5-dehydrogenase  35.36 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07750  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.81 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.370743 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1800  gluconate 5-dehydrogenase  35.74 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.69698  normal  0.0411543 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  34.32 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  34.19 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  37.69 
 
 		 264 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  39.69 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.88 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  34.93 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  33.71 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  34.56 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  35.45 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  35.71 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  35.36 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  39.34 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0441783  normal  0.700268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  34.56 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  34.57 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  34.57 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  34.56 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4768  gluconate 5-dehydrogenase  34.85 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136475  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4738  gluconate 5-dehydrogenase  34.85 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  34.85 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.06 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.21 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  34.83 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 		 263 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.83 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.52 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 		 263 aa  138  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4831  gluconate 5-dehydrogenase  34.47 
 
 		 254 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.71 
 
 		 249 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  33.83 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 		 255 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3360  gluconate 5-dehydrogenase  34.31 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.319469  normal  0.757652 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 269 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04132  gluconate 5-dehydrogenase  34.47 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04096  hypothetical protein  34.47 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4522  gluconate 5-dehydrogenase  34.47 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0305607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4747  gluconate 5-dehydrogenase  34.47 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.91 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  34.47 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 255 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  32.59 
 
 		 264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  33.46 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  35.14 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>