137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3159 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3159  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  100 
 
 
209 aa  424  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4187  metal-dependent hydrolase  50 
 
 
208 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0589  alanyl-tRNA synthetase-related protein  51.44 
 
 
209 aa  216  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.934566  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0617  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  49.28 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4370  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  37.22 
 
 
401 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0256503 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41622  predicted protein  29.58 
 
 
269 aa  79  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261373  hitchhiker  0.0000190197 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11110  alanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07110)  30.88 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2431  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.03 
 
 
389 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.15 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  28.7 
 
 
400 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3635  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.8 
 
 
400 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.9277 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3415  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.27 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3376  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  27.27 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3684  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.27 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3326  alanine--tRNA ligase (alanyl-tRNA synthetase)  27.27 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.07 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1585  alanyl-tRNA synthetase family protein  27.73 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0223949 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  30.87 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  26.01 
 
 
400 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.95 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4033  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.45 
 
 
403 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22843  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.25 
 
 
411 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  25.49 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4376  phosphoesterase DHHA1  31.51 
 
 
406 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.267763  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  25.49 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  25.49 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.14 
 
 
238 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4353  phosphoesterase DHHA1  30.59 
 
 
406 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003302  alanyl-tRNA synthetase domain protein  26.79 
 
 
213 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0917  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  27.92 
 
 
363 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2272  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.38 
 
 
414 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4302  synthetase, putative  28.69 
 
 
262 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.646666  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.46 
 
 
265 aa  62.4  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4632  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.31 
 
 
387 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.29 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.52 
 
 
239 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.51 
 
 
403 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1111  synthetase, putative  29.11 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2333  phage tail protein I  27.18 
 
 
404 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1150  synthetase, putative  29.11 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0599146  normal  0.802365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  25.49 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  25.49 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  25.49 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  25.98 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  29.8 
 
 
926 aa  58.9  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  25.63 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  25.49 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  27.87 
 
 
246 aa  58.2  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0719  alanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
926 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.507157  normal  0.398718 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4881  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.14 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0220  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.76 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.8521  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  29.57 
 
 
925 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
924 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35813  predicted protein  30.94 
 
 
277 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.38 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.31 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  31.38 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.03 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.29 
 
 
408 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 
907 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  26.64 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  27.8 
 
 
250 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
926 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0209  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.88 
 
 
390 aa  52.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.468608 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  28.64 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  29.11 
 
 
237 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  30.13 
 
 
249 aa  52  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.63 
 
 
239 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  28.86 
 
 
239 aa  51.6  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2987  metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  28.7 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.15 
 
 
398 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.41 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2298  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.89 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.231148  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.55 
 
 
383 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.02 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1513  alanyl-tRNA synthetase  39.81 
 
 
915 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53118  Alanyl-tRNA synthetase (Alanine--tRNA ligase) (AlaRS)  25.26 
 
 
430 aa  50.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.523739  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4713  alanyl tRNA synthetase-related protein  26.14 
 
 
212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.601356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  27.66 
 
 
245 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  24.45 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  28.29 
 
 
252 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  38.46 
 
 
432 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  32.71 
 
 
899 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  24.15 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2969  alanyl-tRNA synthetase related protein  26.67 
 
 
214 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  28.17 
 
 
255 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4323  synthetase, putative  26.16 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1334  putative alanyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
913 aa  47.4  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0644  hypothetical protein  27.27 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0776  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.88 
 
 
373 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.08 
 
 
236 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1267  alanyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
914 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.837647  normal  0.239203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  26.75 
 
 
882 aa  46.2  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 
916 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  26.41 
 
 
889 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  23.35 
 
 
889 aa  45.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0578  alanyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
879 aa  45.8  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>