More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35813 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_35813  predicted protein  100 
 
 
277 aa  575  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41622  predicted protein  33.04 
 
 
269 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261373  hitchhiker  0.0000190197 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.13 
 
 
252 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1760  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.73 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000600128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  30.12 
 
 
880 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  28.81 
 
 
880 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  30.13 
 
 
892 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
879 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  26.85 
 
 
879 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1908  alanyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
926 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 
881 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1929  alanyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 
926 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11110  alanyl-tRNA synthetase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07110)  28.16 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1124  alanyl-tRNA synthetase  28.52 
 
 
924 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118182  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0033  alanyl-tRNA synthetase  27 
 
 
925 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 
859 aa  66.6  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
886 aa  66.2  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  27.23 
 
 
899 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 
889 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
886 aa  65.5  0.0000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  26.1 
 
 
870 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 
892 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
896 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
886 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  28.97 
 
 
881 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
889 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  28.85 
 
 
886 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0368  alanyl-tRNA synthetase  25.27 
 
 
889 aa  62.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  25.21 
 
 
243 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  27.76 
 
 
877 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  24.35 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  28.84 
 
 
881 aa  62  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3568  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  25.28 
 
 
408 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.437121  normal  0.758255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
895 aa  61.2  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  27.05 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  28.82 
 
 
889 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0589  alanyl-tRNA synthetase-related protein  28.57 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.934566  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  26.62 
 
 
892 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
892 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  27.35 
 
 
865 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 
892 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  26.26 
 
 
892 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0156  alanyl-tRNA synthetase  24.88 
 
 
848 aa  58.5  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.1 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  24.09 
 
 
910 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1898  alanyl-tRNA synthetase  31.43 
 
 
899 aa  57.4  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0295948  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1361  alanyl-tRNA synthetase  30.85 
 
 
923 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3159  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.94 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  30.15 
 
 
913 aa  56.6  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  24.14 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 
892 aa  56.2  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
905 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.21 
 
 
239 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4187  metal-dependent hydrolase  25.97 
 
 
208 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
905 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  27.71 
 
 
889 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
905 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  27.54 
 
 
880 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
892 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  27.9 
 
 
895 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  28.5 
 
 
890 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 
879 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  29.29 
 
 
874 aa  55.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  25.48 
 
 
867 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 
874 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
874 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  30.92 
 
 
889 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl613  alanyl-tRNA synthetase  25.33 
 
 
892 aa  53.9  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2628  alanyl-tRNA synthetase  27.56 
 
 
874 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0446  alanyl-tRNA synthetase  26.79 
 
 
871 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2498  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  28.17 
 
 
432 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0615615  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  25.83 
 
 
255 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4372  alanyl-tRNA synthetase  26.56 
 
 
889 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  22.26 
 
 
885 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  25.82 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  26.67 
 
 
890 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
874 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1198  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
874 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.400961  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  26.17 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0556  alanyl-tRNA synthetase  26.64 
 
 
893 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1128  alanyl-tRNA synthetase  27.27 
 
 
874 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12986  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1246  alanyl-tRNA synthetase  27.05 
 
 
876 aa  53.5  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  26.86 
 
 
874 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  25.78 
 
 
874 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1038  alanyl-tRNA synthetase  26 
 
 
878 aa  53.5  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1359  alanyl-tRNA synthetase  27.67 
 
 
882 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00180995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  25.91 
 
 
882 aa  53.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1072  alanyl-tRNA synthetase  20.29 
 
 
845 aa  52.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  28.07 
 
 
907 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3115  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
874 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0471495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.07 
 
 
236 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  25.11 
 
 
237 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  26.07 
 
 
236 aa  52.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  27.4 
 
 
856 aa  52.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1250  alanyl-tRNA synthetase  27.69 
 
 
874 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.586835  hitchhiker  0.000000000263081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  28.87 
 
 
874 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1779  alanyl-tRNA synthetase  26.42 
 
 
874 aa  52.4  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1377  alanyl-tRNA synthetase  24.62 
 
 
886 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 
878 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 
877 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>