More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1359 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0050  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 871 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 859 aa  639    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 878 aa  642    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3034  alanyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 888 aa  650    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672449  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_50  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 876 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000334801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 880 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 876 aa  637    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 876 aa  639    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 878 aa  679    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1359  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 882 aa  1763    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00180995  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 885 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 878 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0047  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 871 aa  656    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.620417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0357  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 872 aa  633  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.160702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 876 aa  631  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 880 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2740  alanyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 870 aa  629  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 878 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 865 aa  631  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 865 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 882 aa  626  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1709  alanyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 876 aa  625  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 876 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1675  alanyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 876 aa  625  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 864 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 863 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 889 aa  621  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 876 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002521  alanyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 860 aa  619  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0983  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 875 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0820082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 931 aa  615  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 867 aa  616  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 880 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 876 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 876 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  40.43 
 
 		 876 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 878 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03511  alanyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 865 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 876 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 876 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 876 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 879 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 875 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 876 aa  609  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1182  alanyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 		 876 aa  610  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 905 aa  610  1e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 876 aa  612  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 876 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0457  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 881 aa  611  1e-173  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 875 aa  611  1e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  39.93 
 
 		 860 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 867 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 863 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 882 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 874 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 876 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 879 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 874 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0418  alanyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 865 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 876 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 874 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 876 aa  605  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 874 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 883 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 876 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 874 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0635  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 860 aa  605  1.0000000000000001e-171  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.427199  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 903 aa  599  1e-170  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 879 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 879 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 862 aa  602  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 875 aa  601  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 874 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 884 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 874 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 874 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 897 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 905 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 874 aa  597  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 886 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 897 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 905 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 874 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 900 aa  597  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 875 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 879 aa  595  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 860 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3303  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 871 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.243985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 865 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 874 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 874 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3380  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 867 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.030284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 874 aa  593  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1670  alanyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 872 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.503814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>