More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1694 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 		 885 aa  854    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  61.57 
 
 		 892 aa  1025    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 875 aa  662    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 878 aa  677    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 867 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  61.58 
 
 		 890 aa  966    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 890 aa  886    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 880 aa  688    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 		 903 aa  824    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  49.38 
 
 		 894 aa  767    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 893 aa  784    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 895 aa  817    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 878 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 895 aa  858    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 880 aa  641    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 897 aa  888    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 888 aa  942    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  58.61 
 
 		 889 aa  963    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 874 aa  647    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 876 aa  645    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 879 aa  647    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 892 aa  1021    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 895 aa  874    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 898 aa  868    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 877 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 882 aa  647    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 897 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 876 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 880 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 879 aa  667    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 		 881 aa  635    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 876 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 877 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  83.64 
 
 		 881 aa  1416    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 874 aa  645    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 903 aa  640    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 877 aa  638    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 889 aa  1043    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 876 aa  667    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 874 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 892 aa  1777    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 868 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 876 aa  672    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 884 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 893 aa  841    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 892 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 897 aa  640    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 897 aa  849    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 		 897 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  55.63 
 
 		 893 aa  874    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 879 aa  645    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 879 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 883 aa  687    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 891 aa  895    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 878 aa  672    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 874 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 876 aa  670    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 898 aa  853    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 874 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 879 aa  674    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 880 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.99 
 
 		 890 aa  879    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 892 aa  850    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 897 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 885 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 878 aa  684    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  59.22 
 
 		 886 aa  930    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 878 aa  669    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 882 aa  680    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 896 aa  924    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 897 aa  848    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 897 aa  849    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 902 aa  811    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  53.93 
 
 		 898 aa  849    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 876 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 879 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 904 aa  830    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 896 aa  764    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  64.17 
 
 		 889 aa  1020    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 900 aa  902    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 888 aa  923    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 889 aa  994    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 874 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 886 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 875 aa  632  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 888 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 893 aa  633  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 		 863 aa  633  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0962  alanyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 878 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 879 aa  629  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 864 aa  631  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 889 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  42.99 
 
 		 875 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 876 aa  627  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 876 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 874 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>