More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2135 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 875 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 874 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 874 aa  653    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 		 867 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 884 aa  661    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 880 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 898 aa  869    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3428  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 874 aa  636    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 874 aa  661    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 880 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 880 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 880 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 		 892 aa  1008    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3556  alanyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 899 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 874 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 875 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  68.43 
 
 		 889 aa  1179    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 876 aa  695    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 874 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 886 aa  653    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 886 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 880 aa  646    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4275  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 874 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0551773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 904 aa  864    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 882 aa  710    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 897 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 892 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 876 aa  695    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 874 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 864 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 880 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3267  alanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 874 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.235906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 880 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0022  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 862 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 880 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 881 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 874 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 880 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  61.77 
 
 		 881 aa  999    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 878 aa  703    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 876 aa  650    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 863 aa  649    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 892 aa  1018    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 		 888 aa  654    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 863 aa  635    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 874 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 892 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 876 aa  652    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 897 aa  855    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 876 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 876 aa  651    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 884 aa  678    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 903 aa  639    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 874 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 897 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 897 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 865 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 874 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 879 aa  640    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 879 aa  639    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 874 aa  650    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 859 aa  644    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1127  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 874 aa  637    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.435644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 874 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 869 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 874 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 880 aa  660    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 877 aa  685    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 874 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 874 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 892 aa  1009    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 874 aa  636    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 876 aa  650    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 892 aa  922    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 897 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 878 aa  723    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 878 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 883 aa  637    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  66.09 
 
 		 886 aa  1069    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 878 aa  670    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  61.04 
 
 		 893 aa  989    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 896 aa  1006    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 		 900 aa  643    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  53.92 
 
 		 897 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 		 898 aa  858    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 876 aa  638    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 		 879 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 874 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.93 
 
 		 863 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 880 aa  641    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>