More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2378 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 900 aa  872    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 895 aa  1006    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 875 aa  636    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0744  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 888 aa  636    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.453512  normal  0.711122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 867 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 897 aa  932    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  64 
 
 		 889 aa  1052    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 892 aa  1023    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  54.79 
 
 		 902 aa  930    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 878 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 896 aa  880    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 903 aa  897    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 883 aa  672    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 880 aa  673    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 892 aa  658    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 880 aa  638    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 876 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 879 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 931 aa  636    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 889 aa  1051    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  654    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  56.36 
 
 		 897 aa  885    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 891 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 885 aa  870    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 		 888 aa  1015    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 876 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 882 aa  642    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 897 aa  669    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  54.91 
 
 		 895 aa  926    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 880 aa  703    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 876 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 854 aa  642    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 898 aa  933    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 889 aa  1799    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2617  alanyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 879 aa  636    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00109675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 888 aa  941    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 879 aa  706    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 		 890 aa  905    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 881 aa  1015    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 890 aa  932    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 874 aa  678    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0814  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 893 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  63.43 
 
 		 889 aa  1079    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 874 aa  658    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  56.79 
 
 		 895 aa  956    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 874 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52 
 
 		 904 aa  845    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 874 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 884 aa  670    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 		 863 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 897 aa  678    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 897 aa  840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 874 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 879 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 879 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 889 aa  642    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 		 892 aa  1014    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 878 aa  691    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  58.39 
 
 		 892 aa  1025    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 882 aa  646    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 874 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 874 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  52.31 
 
 		 893 aa  865    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 876 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 892 aa  940    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 897 aa  678    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 893 aa  1008    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 878 aa  657    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 877 aa  673    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  61.77 
 
 		 886 aa  1034    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 878 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 878 aa  703    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 898 aa  857    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 896 aa  994    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 		 897 aa  838    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 897 aa  840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 893 aa  879    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  52.61 
 
 		 898 aa  829    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  51.57 
 
 		 894 aa  854    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  63.26 
 
 		 890 aa  1032    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 874 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 876 aa  634  1e-180  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 876 aa  633  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 880 aa  635  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 886 aa  634  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 877 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 881 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 876 aa  633  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 865 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 860 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 877 aa  634  1e-180  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>