More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2014 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 895 aa  1113    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  49.67 
 
 		 890 aa  811    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 900 aa  752    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 889 aa  857    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  54.2 
 
 		 893 aa  858    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  55.47 
 
 		 894 aa  919    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 897 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 889 aa  911    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 898 aa  930    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 896 aa  1773    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 888 aa  875    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  54.7 
 
 		 890 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 892 aa  917    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 881 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  55 
 
 		 897 aa  886    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  63.32 
 
 		 902 aa  1124    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 892 aa  910    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 		 893 aa  954    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  69.38 
 
 		 895 aa  1202    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 895 aa  1167    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 903 aa  860    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 898 aa  745    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 893 aa  1017    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 889 aa  951    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 897 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 888 aa  892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 885 aa  837    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  70.54 
 
 		 897 aa  1134    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  51.96 
 
 		 892 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 892 aa  921    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 890 aa  794    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 889 aa  890    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 886 aa  893    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 891 aa  805    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  57.86 
 
 		 896 aa  938    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 		 897 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 		 898 aa  758    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 904 aa  735    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 		 878 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 878 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 892 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 879 aa  626  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 880 aa  624  1e-177  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 876 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 882 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 886 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 886 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 876 aa  612  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 878 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 886 aa  612  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 884 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 879 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 		 875 aa  599  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 874 aa  599  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 874 aa  601  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 867 aa  592  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 883 aa  595  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02846  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 865 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.12148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 882 aa  595  1e-168  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 879 aa  594  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 889 aa  594  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 876 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  0.0000367228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 905 aa  590  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 880 aa  590  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1167  alanyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 885 aa  592  1e-167  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2527  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 885 aa  592  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000729274  hitchhiker  0.00002729 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 876 aa  588  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 860 aa  587  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  39.23 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 863 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 884 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 876 aa  588  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 864 aa  587  1e-166  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 905 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 874 aa  588  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 905 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 865 aa  587  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 876 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 869 aa  589  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 878 aa  587  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 890 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 874 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 876 aa  586  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1536  alanyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 856 aa  583  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000027092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 874 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 897 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>