More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2070 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 876 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 876 aa  656    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777298  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 886 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 		 875 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 905 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 892 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 867 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 887 aa  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 884 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4471  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 880 aa  653    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00256411  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 892 aa  978    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3101  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 880 aa  654    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.438368  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 876 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000468314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1842  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 874 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.742593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4284  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 880 aa  656    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4121  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 880 aa  653    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000164484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4132  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 880 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 874 aa  658    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 860 aa  639    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 860 aa  642    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  669    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0072  alanyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 860 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.163524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 889 aa  1800    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 874 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0553  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 886 aa  650    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  56.41 
 
 		 898 aa  909    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 880 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  43.74 
 
 		 906 aa  635    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 931 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 		 876 aa  637    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 882 aa  665    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 897 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  56.14 
 
 		 897 aa  899    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 876 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 880 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 864 aa  675    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4616  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 880 aa  656    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00215408  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 886 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0876  alanyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 899 aa  645    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.27264  normal  0.0167096 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 859 aa  643    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 881 aa  669    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2661  alanyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 874 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0305008  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 893 aa  953    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 881 aa  942    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 877 aa  696    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4612  alanyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 		 874 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 891 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4235  alanyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 880 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.688921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 880 aa  760    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0568  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 874 aa  657    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  58.49 
 
 		 892 aa  950    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1038  alanyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 878 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.256869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 880 aa  678    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 878 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1638  alanyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 890 aa  640    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 884 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1499  alanyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 867 aa  664    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 889 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 897 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 897 aa  901    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3172  alanyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 875 aa  646    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0289065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 865 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 896 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 879 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 879 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 874 aa  660    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4806  alanyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 874 aa  647    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00251805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  58.13 
 
 		 892 aa  983    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1611  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 903 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0248511  hitchhiker  0.0000135737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1481  alanyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 		 869 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 883 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 880 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 863 aa  654    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 874 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52600  alanyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 874 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2903  alanyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 892 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0357783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 904 aa  923    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 874 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 892 aa  920    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 897 aa  670    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 876 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 878 aa  652    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 876 aa  657    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000353011  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  62.2 
 
 		 886 aa  1020    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 878 aa  678    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 863 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  55.54 
 
 		 896 aa  913    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1048  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 900 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  56.25 
 
 		 897 aa  901    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00511  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 886 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 		 898 aa  906    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 876 aa  647    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 879 aa  655    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>