More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  68.14 
 
 		 896 aa  1069    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 895 aa  1793    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  56.54 
 
 		 894 aa  973    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 878 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 890 aa  883    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 900 aa  854    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 		 898 aa  957    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  58.44 
 
 		 889 aa  1011    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 893 aa  1018    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 889 aa  989    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 897 aa  815    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 895 aa  1177    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  55.94 
 
 		 890 aa  873    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 888 aa  885    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 893 aa  876    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 876 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 876 aa  642    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 		 897 aa  925    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 		 904 aa  787    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 878 aa  653    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 889 aa  941    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 881 aa  854    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  57.76 
 
 		 903 aa  939    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  53.39 
 
 		 891 aa  855    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  55.11 
 
 		 892 aa  938    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 892 aa  926    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 		 892 aa  856    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 897 aa  817    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 888 aa  924    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 876 aa  648    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  62.75 
 
 		 893 aa  1058    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 897 aa  1085    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 879 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 892 aa  952    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  69.84 
 
 		 895 aa  1255    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 885 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  60.2 
 
 		 902 aa  1044    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 886 aa  945    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  57.13 
 
 		 896 aa  908    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 898 aa  822    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 897 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 898 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  54.63 
 
 		 890 aa  893    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 880 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  56.89 
 
 		 889 aa  913    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0658  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 889 aa  645    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 		 883 aa  633  1e-180  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1452  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 879 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 877 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1423  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 879 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 876 aa  625  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 905 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 879 aa  625  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 878 aa  622  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 892 aa  625  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 882 aa  622  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 905 aa  622  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0226  alanyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 880 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  37.54 
 
 		 886 aa  618  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 880 aa  616  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 905 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05100  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 878 aa  613  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.637109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3088  alanyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 880 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0045  alanyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 886 aa  612  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.214669  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 875 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 874 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 882 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 884 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 		 931 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 886 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 875 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32618  predicted protein  42.49 
 
 		 906 aa  610  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.63515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 877 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 877 aa  610  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 864 aa  612  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 905 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 874 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3635  alanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 889 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.988674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 874 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 878 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 904 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 878 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 878 aa  605  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 867 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0898  alanyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 881 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1281  alanyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 859 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 865 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 868 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1946  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 890 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197292  hitchhiker  0.00683804 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1763  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 860 aa  599  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1763  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 860 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 881 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 879 aa  602  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 874 aa  601  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  0.00000132365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 876 aa  599  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 880 aa  602  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 874 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 874 aa  602  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>