109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1429 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  100 
 
 		 435 aa  907    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1699  polysaccharide export protein  56.81 
 
 		 420 aa  498  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  59.2 
 
 		 422 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  58.03 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3795  cold shock protein  40.05 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  40.44 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3249  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.98 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  26.04 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 852 aa  59.3  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  25.63 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  27.63 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.41 
 
 		 931 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 221 aa  54.7  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  26.59 
 
 		 921 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 920 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  25.13 
 
 		 212 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  22.99 
 
 		 214 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  25.41 
 
 		 919 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  27.14 
 
 		 384 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 915 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  23.68 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.5 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  24.37 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  24.28 
 
 		 912 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 186 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  26.52 
 
 		 828 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 919 aa  51.6  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  27.66 
 
 		 357 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  24.58 
 
 		 579 aa  50.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 830 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  22.66 
 
 		 869 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  23.61 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  28.88 
 
 		 247 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16271  hypothetical protein  30.59 
 
 		 577 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  26.34 
 
 		 387 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.16 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  20.83 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  24.88 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.26 
 
 		 175 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  25.41 
 
 		 828 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  24.76 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.28 
 
 		 922 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  27.91 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  22.65 
 
 		 910 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  24.57 
 
 		 603 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  24.16 
 
 		 606 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.59 
 
 		 827 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 869 aa  47.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.29 
 
 		 189 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  25.79 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.31 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  28.09 
 
 		 587 aa  47  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.8 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  25.79 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  29.9 
 
 		 558 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  29.9 
 
 		 558 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  23.04 
 
 		 537 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  20.6 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.16 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  23.83 
 
 		 201 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  24.44 
 
 		 700 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  23.61 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.52 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  26.37 
 
 		 187 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08781  hypothetical protein  23.67 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000165811 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.52 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  23.86 
 
 		 947 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  26 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  22.49 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  23.91 
 
 		 508 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  25 
 
 		 191 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0024  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 1070 aa  44.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172785  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  28.87 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  25.49 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  25.49 
 
 		 387 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  25.49 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  24.42 
 
 		 609 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  26.85 
 
 		 232 aa  44.3  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  25.13 
 
 		 350 aa  43.9  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>