42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1699 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1699  polysaccharide export protein  100 
 
 		 420 aa  863    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  62.32 
 
 		 439 aa  521  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  56.81 
 
 		 435 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  55.8 
 
 		 422 aa  472  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3795  cold shock protein  38.96 
 
 		 433 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3249  polysaccharide biosynthesis/export protein  40.06 
 
 		 425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  38.61 
 
 		 347 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  22.58 
 
 		 478 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  25.38 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  28.28 
 
 		 869 aa  53.5  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  24.64 
 
 		 454 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  24.64 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  23.18 
 
 		 371 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.06 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  23.51 
 
 		 473 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  22.56 
 
 		 869 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.26 
 
 		 603 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  24.53 
 
 		 357 aa  46.6  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 834 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  23.78 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.68 
 
 		 551 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 272 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  22.27 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 936 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.34 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  22.03 
 
 		 915 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2859  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 209 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2951  polysaccharide export protein  26.24 
 
 		 210 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 201 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 833 aa  43.1  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>