115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3795 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3795  cold shock protein  100 
 
 		 433 aa  888    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3249  polysaccharide biosynthesis/export protein  50.73 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  40.05 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  43.08 
 
 		 347 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  42.32 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1699  polysaccharide export protein  38.96 
 
 		 420 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  42.44 
 
 		 439 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  29.35 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  31.61 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  30.97 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  33.33 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.38 
 
 		 495 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 264 aa  53.9  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  29.83 
 
 		 227 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 348 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  23.88 
 
 		 869 aa  53.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.06 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  26.55 
 
 		 379 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  24.21 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  29.61 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  30.67 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  25.12 
 
 		 551 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  27.94 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 387 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.27 
 
 		 352 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 201 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.32 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.31 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  31.33 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.55 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.55 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.55 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.44 
 
 		 920 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 348 aa  50.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  24.72 
 
 		 508 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.83 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.22 
 
 		 446 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.22 
 
 		 400 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.09 
 
 		 232 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  25.11 
 
 		 341 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 603 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  22.04 
 
 		 919 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 828 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  25.82 
 
 		 184 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  23.08 
 
 		 812 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 915 aa  47.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  26.78 
 
 		 277 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  31.63 
 
 		 558 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.65 
 
 		 781 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  27.93 
 
 		 229 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  26.04 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  24.6 
 
 		 191 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 185 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  30.61 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 185 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  26.46 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  24.89 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  25.32 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  26.82 
 
 		 185 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  21.93 
 
 		 495 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  25.32 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  30.61 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  23.9 
 
 		 869 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 803 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.57 
 
 		 828 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  22.46 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  28.42 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  25.15 
 
 		 333 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.75 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  21.99 
 
 		 910 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  23.9 
 
 		 827 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 948 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  23.35 
 
 		 922 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>