85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3249 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3249  polysaccharide biosynthesis/export protein  100 
 
 		 425 aa  876    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3795  cold shock protein  50.73 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  42.45 
 
 		 347 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  41.14 
 
 		 422 aa  260  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  38.75 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1699  polysaccharide export protein  40.06 
 
 		 420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  41.08 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  28.26 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  26.27 
 
 		 372 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  25.84 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 191 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  27.94 
 
 		 352 aa  50.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 191 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  23.11 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  26.07 
 
 		 869 aa  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  36.17 
 
 		 189 aa  50.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  25.59 
 
 		 367 aa  50.1  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  25.43 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  27.47 
 
 		 196 aa  49.7  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.63 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.63 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.63 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  22.1 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.63 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  27.47 
 
 		 195 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  25.43 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 192 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  25.63 
 
 		 196 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  26.49 
 
 		 187 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.99 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  26.59 
 
 		 247 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3593  polysaccharide export protein  25 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  22.51 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2513  polysaccharide export protein  25 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  25.74 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  22.51 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  24.46 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 852 aa  48.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27.23 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  26.42 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  34.62 
 
 		 191 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  25.37 
 
 		 391 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  30.65 
 
 		 551 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  23.7 
 
 		 417 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 351 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 389 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.4 
 
 		 877 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.99 
 
 		 422 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  24.3 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.88 
 
 		 877 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  24.63 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  24.88 
 
 		 800 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.28 
 
 		 781 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  23.27 
 
 		 922 aa  46.6  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 234 aa  46.2  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  26.11 
 
 		 875 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2021  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  24.63 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  25.11 
 
 		 249 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  24.46 
 
 		 333 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  27.41 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  22.46 
 
 		 350 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  24.67 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  29.57 
 
 		 237 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 492 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  22.41 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  23.3 
 
 		 206 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  27.46 
 
 		 309 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.78 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  27.74 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  28.82 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  21.79 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  23.7 
 
 		 190 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  34.92 
 
 		 195 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  22.29 
 
 		 398 aa  43.1  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  23.33 
 
 		 558 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  31.82 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  23.33 
 
 		 558 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 431 aa  43.1  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>