94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2678 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2678  polysaccharide export protein  100 
 
 
347 aa  693    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3795  cold shock protein  43.08 
 
 
433 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3249  polysaccharide biosynthesis/export protein  42.45 
 
 
425 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.594597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1429  polysaccharide export protein  40.44 
 
 
435 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  38.51 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.054742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2946  polysaccharide export protein  40.51 
 
 
439 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1699  polysaccharide export protein  38.61 
 
 
420 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.126093  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.87 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.87 
 
 
400 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.87 
 
 
446 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.87 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  28.87 
 
 
478 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  24.88 
 
 
246 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  29.02 
 
 
495 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  26.94 
 
 
495 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  27.32 
 
 
852 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.94 
 
 
495 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  31.33 
 
 
417 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  25.41 
 
 
920 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  28.08 
 
 
558 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  26.52 
 
 
919 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  23.81 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  24.86 
 
 
912 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.39 
 
 
473 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  30.3 
 
 
385 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  26.19 
 
 
869 aa  53.1  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  30.3 
 
 
391 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
921 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
348 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  24.58 
 
 
910 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  23.2 
 
 
922 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.47 
 
 
551 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3716  polysaccharide export protein  30.3 
 
 
241 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  25.82 
 
 
931 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  27.71 
 
 
384 aa  50.8  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  29 
 
 
389 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  26.8 
 
 
492 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  25.14 
 
 
827 aa  50.4  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  23.44 
 
 
214 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  25.16 
 
 
357 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  27.11 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  23.86 
 
 
869 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.38 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  25.84 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  23.93 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  28.89 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.04 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.04 
 
 
391 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  27.61 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  27.93 
 
 
849 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  24.86 
 
 
187 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.04 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  23.76 
 
 
915 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  23.66 
 
 
919 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  23.53 
 
 
379 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.04 
 
 
396 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  28.08 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.56 
 
 
397 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  27.14 
 
 
350 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  24.84 
 
 
196 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  24.73 
 
 
828 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  27.68 
 
 
537 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  24.73 
 
 
828 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  28.89 
 
 
558 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  34.44 
 
 
419 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  31.51 
 
 
387 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  28.89 
 
 
558 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  29.71 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  28.89 
 
 
558 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
455 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  27.32 
 
 
606 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  27.61 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  26.2 
 
 
992 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  23.81 
 
 
897 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  27.07 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  24.29 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  24.48 
 
 
392 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  27.86 
 
 
781 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
455 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1375  polysaccharide export-related periplasmic protein  22.58 
 
 
415 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00608351  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
392 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  24.62 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  26.4 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  24.48 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  31.11 
 
 
205 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  25.64 
 
 
947 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  26.29 
 
 
191 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  28.03 
 
 
417 aa  43.1  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  26.82 
 
 
869 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  27.37 
 
 
576 aa  42.7  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  24.31 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>